Protein–RNA interactions for Protein: P60335

Pcbp1, Poly(rC)-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp1P60335 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pcbp1P60335 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pcbp1P60335 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pcbp1P60335 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pcbp1P60335 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pcbp1P60335 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pcbp1P60335 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pcbp1P60335 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pcbp1P60335 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pcbp1P60335 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Pcbp1P60335 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pcbp1P60335 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Pcbp1P60335 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pcbp1P60335 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pcbp1P60335 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pcbp1P60335 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pcbp1P60335 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pcbp1P60335 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pcbp1P60335 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pcbp1P60335 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pcbp1P60335 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcbp1P60335 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcbp1P60335 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcbp1P60335 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcbp1P60335 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcbp1P60335 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcbp1P60335 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcbp1P60335 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcbp1P60335 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pcbp1P60335 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pcbp1P60335 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pcbp1P60335 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pcbp1P60335 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pcbp1P60335 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pcbp1P60335 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pcbp1P60335 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pcbp1P60335 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pcbp1P60335 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.27■■□□□ 1.31
Pcbp1P60335 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pcbp1P60335 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pcbp1P60335 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Pcbp1P60335 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pcbp1P60335 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pcbp1P60335 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pcbp1P60335 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcbp1P60335 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcbp1P60335 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcbp1P60335 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcbp1P60335 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcbp1P60335 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcbp1P60335 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcbp1P60335 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcbp1P60335 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcbp1P60335 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcbp1P60335 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcbp1P60335 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcbp1P60335 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcbp1P60335 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcbp1P60335 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcbp1P60335 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Pcbp1P60335 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pcbp1P60335 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pcbp1P60335 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pcbp1P60335 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pcbp1P60335 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pcbp1P60335 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pcbp1P60335 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcbp1P60335 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcbp1P60335 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcbp1P60335 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcbp1P60335 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcbp1P60335 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pcbp1P60335 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pcbp1P60335 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pcbp1P60335 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pcbp1P60335 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pcbp1P60335 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcbp1P60335 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcbp1P60335 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcbp1P60335 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcbp1P60335 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcbp1P60335 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcbp1P60335 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcbp1P60335 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcbp1P60335 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcbp1P60335 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcbp1P60335 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcbp1P60335 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcbp1P60335 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcbp1P60335 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcbp1P60335 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcbp1P60335 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcbp1P60335 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcbp1P60335 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcbp1P60335 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcbp1P60335 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcbp1P60335 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcbp1P60335 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcbp1P60335 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcbp1P60335 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms