Protein–RNA interactions for Protein: P59438

Hps5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps5P59438 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hps5P59438 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hps5P59438 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hps5P59438 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hps5P59438 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hps5P59438 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hps5P59438 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hps5P59438 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hps5P59438 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hps5P59438 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hps5P59438 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Hps5P59438 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Hps5P59438 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hps5P59438 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hps5P59438 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hps5P59438 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hps5P59438 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hps5P59438 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hps5P59438 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hps5P59438 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hps5P59438 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hps5P59438 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hps5P59438 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hps5P59438 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Hps5P59438 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hps5P59438 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hps5P59438 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hps5P59438 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hps5P59438 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hps5P59438 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Hps5P59438 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hps5P59438 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hps5P59438 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hps5P59438 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hps5P59438 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hps5P59438 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hps5P59438 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hps5P59438 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hps5P59438 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hps5P59438 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hps5P59438 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hps5P59438 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hps5P59438 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hps5P59438 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hps5P59438 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hps5P59438 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hps5P59438 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hps5P59438 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hps5P59438 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hps5P59438 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hps5P59438 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hps5P59438 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hps5P59438 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hps5P59438 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hps5P59438 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hps5P59438 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hps5P59438 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hps5P59438 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Hps5P59438 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hps5P59438 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hps5P59438 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hps5P59438 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Hps5P59438 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hps5P59438 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hps5P59438 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hps5P59438 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Hps5P59438 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Hps5P59438 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hps5P59438 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hps5P59438 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hps5P59438 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hps5P59438 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hps5P59438 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hps5P59438 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hps5P59438 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hps5P59438 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hps5P59438 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hps5P59438 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hps5P59438 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hps5P59438 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hps5P59438 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hps5P59438 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hps5P59438 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hps5P59438 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hps5P59438 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hps5P59438 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Hps5P59438 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hps5P59438 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hps5P59438 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hps5P59438 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hps5P59438 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hps5P59438 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Hps5P59438 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hps5P59438 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hps5P59438 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hps5P59438 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hps5P59438 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Hps5P59438 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Hps5P59438 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hps5P59438 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms