Protein–RNA interactions for Protein: P59055

Csrnp3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp3P59055 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Csrnp3P59055 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Csrnp3P59055 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Csrnp3P59055 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Csrnp3P59055 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Csrnp3P59055 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Csrnp3P59055 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Csrnp3P59055 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Csrnp3P59055 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Csrnp3P59055 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Csrnp3P59055 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Csrnp3P59055 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Csrnp3P59055 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Csrnp3P59055 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Csrnp3P59055 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Csrnp3P59055 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Csrnp3P59055 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Csrnp3P59055 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Csrnp3P59055 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Csrnp3P59055 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Csrnp3P59055 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Csrnp3P59055 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Csrnp3P59055 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Csrnp3P59055 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Csrnp3P59055 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Csrnp3P59055 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Csrnp3P59055 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Csrnp3P59055 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Csrnp3P59055 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Csrnp3P59055 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Csrnp3P59055 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Csrnp3P59055 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Csrnp3P59055 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Csrnp3P59055 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Csrnp3P59055 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Csrnp3P59055 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Csrnp3P59055 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Csrnp3P59055 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Csrnp3P59055 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Csrnp3P59055 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Csrnp3P59055 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Csrnp3P59055 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Csrnp3P59055 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Csrnp3P59055 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Csrnp3P59055 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Csrnp3P59055 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Csrnp3P59055 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Csrnp3P59055 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Csrnp3P59055 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Csrnp3P59055 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Csrnp3P59055 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Csrnp3P59055 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Csrnp3P59055 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Csrnp3P59055 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Csrnp3P59055 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Csrnp3P59055 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Csrnp3P59055 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Csrnp3P59055 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Csrnp3P59055 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
Csrnp3P59055 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Csrnp3P59055 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Csrnp3P59055 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Csrnp3P59055 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
Csrnp3P59055 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Csrnp3P59055 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Csrnp3P59055 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Csrnp3P59055 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Csrnp3P59055 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Csrnp3P59055 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Csrnp3P59055 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Csrnp3P59055 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Csrnp3P59055 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Csrnp3P59055 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Csrnp3P59055 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Csrnp3P59055 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Csrnp3P59055 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Csrnp3P59055 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Csrnp3P59055 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Csrnp3P59055 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Csrnp3P59055 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Csrnp3P59055 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Csrnp3P59055 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Csrnp3P59055 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Csrnp3P59055 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Csrnp3P59055 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Csrnp3P59055 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Csrnp3P59055 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Csrnp3P59055 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Csrnp3P59055 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Csrnp3P59055 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Csrnp3P59055 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Csrnp3P59055 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Csrnp3P59055 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Csrnp3P59055 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Csrnp3P59055 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Csrnp3P59055 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Csrnp3P59055 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Csrnp3P59055 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Csrnp3P59055 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Csrnp3P59055 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms