Protein–RNA interactions for Protein: P58466

Ctdsp1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp1P58466 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctdsp1P58466 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctdsp1P58466 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctdsp1P58466 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctdsp1P58466 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctdsp1P58466 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctdsp1P58466 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctdsp1P58466 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctdsp1P58466 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctdsp1P58466 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctdsp1P58466 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctdsp1P58466 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ctdsp1P58466 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctdsp1P58466 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctdsp1P58466 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctdsp1P58466 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctdsp1P58466 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctdsp1P58466 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctdsp1P58466 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctdsp1P58466 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctdsp1P58466 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ctdsp1P58466 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ctdsp1P58466 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ctdsp1P58466 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ctdsp1P58466 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ctdsp1P58466 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ctdsp1P58466 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ctdsp1P58466 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ctdsp1P58466 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ctdsp1P58466 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ctdsp1P58466 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ctdsp1P58466 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ctdsp1P58466 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ctdsp1P58466 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ctdsp1P58466 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ctdsp1P58466 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ctdsp1P58466 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ctdsp1P58466 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ctdsp1P58466 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ctdsp1P58466 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ctdsp1P58466 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ctdsp1P58466 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ctdsp1P58466 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ctdsp1P58466 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ctdsp1P58466 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ctdsp1P58466 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ctdsp1P58466 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ctdsp1P58466 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ctdsp1P58466 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ctdsp1P58466 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ctdsp1P58466 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ctdsp1P58466 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ctdsp1P58466 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ctdsp1P58466 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ctdsp1P58466 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ctdsp1P58466 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ctdsp1P58466 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ctdsp1P58466 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ctdsp1P58466 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctdsp1P58466 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctdsp1P58466 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctdsp1P58466 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctdsp1P58466 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctdsp1P58466 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctdsp1P58466 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctdsp1P58466 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctdsp1P58466 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctdsp1P58466 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctdsp1P58466 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctdsp1P58466 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctdsp1P58466 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctdsp1P58466 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctdsp1P58466 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctdsp1P58466 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctdsp1P58466 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctdsp1P58466 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctdsp1P58466 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctdsp1P58466 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctdsp1P58466 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctdsp1P58466 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctdsp1P58466 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctdsp1P58466 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctdsp1P58466 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctdsp1P58466 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctdsp1P58466 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctdsp1P58466 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctdsp1P58466 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctdsp1P58466 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctdsp1P58466 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctdsp1P58466 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctdsp1P58466 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctdsp1P58466 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctdsp1P58466 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctdsp1P58466 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctdsp1P58466 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctdsp1P58466 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctdsp1P58466 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctdsp1P58466 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctdsp1P58466 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctdsp1P58466 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms