Protein–RNA interactions for Protein: P58389

Ptpa, Serine/threonine-protein phosphatase 2A activator, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpaP58389 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PtpaP58389 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PtpaP58389 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PtpaP58389 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PtpaP58389 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PtpaP58389 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PtpaP58389 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PtpaP58389 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PtpaP58389 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PtpaP58389 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PtpaP58389 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PtpaP58389 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PtpaP58389 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PtpaP58389 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PtpaP58389 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PtpaP58389 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PtpaP58389 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PtpaP58389 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PtpaP58389 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PtpaP58389 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PtpaP58389 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PtpaP58389 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PtpaP58389 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PtpaP58389 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PtpaP58389 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PtpaP58389 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PtpaP58389 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PtpaP58389 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PtpaP58389 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PtpaP58389 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PtpaP58389 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PtpaP58389 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PtpaP58389 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PtpaP58389 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PtpaP58389 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PtpaP58389 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PtpaP58389 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PtpaP58389 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PtpaP58389 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PtpaP58389 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PtpaP58389 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PtpaP58389 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PtpaP58389 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PtpaP58389 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PtpaP58389 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PtpaP58389 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PtpaP58389 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PtpaP58389 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PtpaP58389 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PtpaP58389 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PtpaP58389 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PtpaP58389 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PtpaP58389 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PtpaP58389 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PtpaP58389 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PtpaP58389 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PtpaP58389 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PtpaP58389 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PtpaP58389 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PtpaP58389 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PtpaP58389 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PtpaP58389 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PtpaP58389 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PtpaP58389 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PtpaP58389 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PtpaP58389 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PtpaP58389 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PtpaP58389 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PtpaP58389 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtpaP58389 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtpaP58389 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtpaP58389 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtpaP58389 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtpaP58389 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtpaP58389 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtpaP58389 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtpaP58389 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtpaP58389 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtpaP58389 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtpaP58389 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtpaP58389 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtpaP58389 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PtpaP58389 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PtpaP58389 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtpaP58389 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtpaP58389 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PtpaP58389 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PtpaP58389 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PtpaP58389 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PtpaP58389 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PtpaP58389 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PtpaP58389 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PtpaP58389 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PtpaP58389 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PtpaP58389 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PtpaP58389 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PtpaP58389 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PtpaP58389 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PtpaP58389 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PtpaP58389 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84 ms