Protein–RNA interactions for Protein: P58321

Uchl4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L4, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl4P58321 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Uchl4P58321 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Uchl4P58321 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Uchl4P58321 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Uchl4P58321 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Uchl4P58321 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Uchl4P58321 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Uchl4P58321 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Uchl4P58321 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Uchl4P58321 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Uchl4P58321 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Uchl4P58321 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Uchl4P58321 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Uchl4P58321 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Uchl4P58321 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Uchl4P58321 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Uchl4P58321 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Uchl4P58321 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Uchl4P58321 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Uchl4P58321 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Uchl4P58321 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Uchl4P58321 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Uchl4P58321 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Uchl4P58321 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Uchl4P58321 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Uchl4P58321 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Uchl4P58321 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Uchl4P58321 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Uchl4P58321 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Uchl4P58321 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Uchl4P58321 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Uchl4P58321 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Uchl4P58321 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Uchl4P58321 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Uchl4P58321 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Uchl4P58321 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Uchl4P58321 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Uchl4P58321 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Uchl4P58321 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Uchl4P58321 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Uchl4P58321 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Uchl4P58321 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Uchl4P58321 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Uchl4P58321 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Uchl4P58321 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Uchl4P58321 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Uchl4P58321 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Uchl4P58321 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Uchl4P58321 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Uchl4P58321 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Uchl4P58321 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Uchl4P58321 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Uchl4P58321 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Uchl4P58321 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Uchl4P58321 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Uchl4P58321 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Uchl4P58321 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Uchl4P58321 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Uchl4P58321 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Uchl4P58321 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Uchl4P58321 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Uchl4P58321 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Uchl4P58321 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Uchl4P58321 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Uchl4P58321 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Uchl4P58321 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Uchl4P58321 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Uchl4P58321 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Uchl4P58321 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Uchl4P58321 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Uchl4P58321 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Uchl4P58321 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Uchl4P58321 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Uchl4P58321 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Uchl4P58321 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Uchl4P58321 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Uchl4P58321 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Uchl4P58321 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Uchl4P58321 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Uchl4P58321 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Uchl4P58321 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Uchl4P58321 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Uchl4P58321 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Uchl4P58321 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Uchl4P58321 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Uchl4P58321 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Uchl4P58321 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Uchl4P58321 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Uchl4P58321 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Uchl4P58321 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Uchl4P58321 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Uchl4P58321 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Uchl4P58321 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Uchl4P58321 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Uchl4P58321 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Uchl4P58321 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Uchl4P58321 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Uchl4P58321 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Uchl4P58321 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Uchl4P58321 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms