Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NcstnP57716 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NcstnP57716 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NcstnP57716 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NcstnP57716 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NcstnP57716 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NcstnP57716 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NcstnP57716 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NcstnP57716 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NcstnP57716 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NcstnP57716 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NcstnP57716 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NcstnP57716 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NcstnP57716 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NcstnP57716 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NcstnP57716 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NcstnP57716 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NcstnP57716 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NcstnP57716 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NcstnP57716 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NcstnP57716 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NcstnP57716 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NcstnP57716 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
NcstnP57716 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NcstnP57716 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NcstnP57716 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NcstnP57716 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NcstnP57716 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NcstnP57716 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NcstnP57716 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
NcstnP57716 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NcstnP57716 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NcstnP57716 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NcstnP57716 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NcstnP57716 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NcstnP57716 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NcstnP57716 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NcstnP57716 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NcstnP57716 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NcstnP57716 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
NcstnP57716 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NcstnP57716 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NcstnP57716 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NcstnP57716 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NcstnP57716 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NcstnP57716 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NcstnP57716 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NcstnP57716 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NcstnP57716 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NcstnP57716 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NcstnP57716 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NcstnP57716 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NcstnP57716 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NcstnP57716 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NcstnP57716 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NcstnP57716 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NcstnP57716 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NcstnP57716 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NcstnP57716 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NcstnP57716 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NcstnP57716 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
NcstnP57716 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NcstnP57716 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NcstnP57716 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NcstnP57716 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NcstnP57716 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NcstnP57716 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NcstnP57716 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NcstnP57716 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
NcstnP57716 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
NcstnP57716 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NcstnP57716 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NcstnP57716 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NcstnP57716 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NcstnP57716 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NcstnP57716 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NcstnP57716 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NcstnP57716 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NcstnP57716 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NcstnP57716 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NcstnP57716 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NcstnP57716 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NcstnP57716 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
NcstnP57716 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NcstnP57716 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
NcstnP57716 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NcstnP57716 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NcstnP57716 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NcstnP57716 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NcstnP57716 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NcstnP57716 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NcstnP57716 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NcstnP57716 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NcstnP57716 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NcstnP57716 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NcstnP57716 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NcstnP57716 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NcstnP57716 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NcstnP57716 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NcstnP57716 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms