Protein–RNA interactions for Protein: P56726

Smo, Smoothened homolog, mousemouse

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Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmoP56726 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SmoP56726 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SmoP56726 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SmoP56726 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SmoP56726 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SmoP56726 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SmoP56726 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SmoP56726 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SmoP56726 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SmoP56726 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SmoP56726 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SmoP56726 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SmoP56726 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SmoP56726 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SmoP56726 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SmoP56726 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SmoP56726 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SmoP56726 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SmoP56726 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SmoP56726 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SmoP56726 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SmoP56726 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SmoP56726 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SmoP56726 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SmoP56726 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SmoP56726 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SmoP56726 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SmoP56726 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SmoP56726 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SmoP56726 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SmoP56726 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SmoP56726 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SmoP56726 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SmoP56726 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SmoP56726 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SmoP56726 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SmoP56726 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SmoP56726 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SmoP56726 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SmoP56726 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SmoP56726 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SmoP56726 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SmoP56726 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SmoP56726 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SmoP56726 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SmoP56726 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SmoP56726 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SmoP56726 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SmoP56726 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SmoP56726 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SmoP56726 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SmoP56726 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SmoP56726 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SmoP56726 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SmoP56726 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SmoP56726 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SmoP56726 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SmoP56726 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SmoP56726 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SmoP56726 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SmoP56726 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SmoP56726 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SmoP56726 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SmoP56726 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SmoP56726 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SmoP56726 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SmoP56726 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SmoP56726 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SmoP56726 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SmoP56726 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SmoP56726 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SmoP56726 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SmoP56726 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SmoP56726 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SmoP56726 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SmoP56726 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SmoP56726 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SmoP56726 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SmoP56726 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SmoP56726 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SmoP56726 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SmoP56726 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SmoP56726 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SmoP56726 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SmoP56726 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SmoP56726 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SmoP56726 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SmoP56726 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SmoP56726 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SmoP56726 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SmoP56726 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SmoP56726 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SmoP56726 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SmoP56726 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SmoP56726 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SmoP56726 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SmoP56726 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SmoP56726 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SmoP56726 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SmoP56726 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
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