Protein–RNA interactions for Protein: P56656

Cyp2c39, Cytochrome P450 2C39, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2c39P56656 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cyp2c39P56656 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cyp2c39P56656 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cyp2c39P56656 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cyp2c39P56656 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cyp2c39P56656 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cyp2c39P56656 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cyp2c39P56656 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Cyp2c39P56656 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cyp2c39P56656 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cyp2c39P56656 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cyp2c39P56656 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cyp2c39P56656 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cyp2c39P56656 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Cyp2c39P56656 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cyp2c39P56656 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cyp2c39P56656 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Cyp2c39P56656 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cyp2c39P56656 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cyp2c39P56656 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cyp2c39P56656 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cyp2c39P56656 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Cyp2c39P56656 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cyp2c39P56656 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cyp2c39P56656 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cyp2c39P56656 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cyp2c39P56656 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cyp2c39P56656 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cyp2c39P56656 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cyp2c39P56656 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cyp2c39P56656 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cyp2c39P56656 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cyp2c39P56656 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cyp2c39P56656 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cyp2c39P56656 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cyp2c39P56656 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cyp2c39P56656 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cyp2c39P56656 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cyp2c39P56656 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cyp2c39P56656 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cyp2c39P56656 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cyp2c39P56656 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cyp2c39P56656 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cyp2c39P56656 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cyp2c39P56656 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cyp2c39P56656 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cyp2c39P56656 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cyp2c39P56656 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cyp2c39P56656 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cyp2c39P56656 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cyp2c39P56656 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cyp2c39P56656 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cyp2c39P56656 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cyp2c39P56656 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cyp2c39P56656 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cyp2c39P56656 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cyp2c39P56656 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cyp2c39P56656 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cyp2c39P56656 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Cyp2c39P56656 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cyp2c39P56656 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cyp2c39P56656 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Cyp2c39P56656 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cyp2c39P56656 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cyp2c39P56656 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cyp2c39P56656 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cyp2c39P56656 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cyp2c39P56656 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cyp2c39P56656 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cyp2c39P56656 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cyp2c39P56656 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cyp2c39P56656 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cyp2c39P56656 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cyp2c39P56656 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cyp2c39P56656 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cyp2c39P56656 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cyp2c39P56656 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cyp2c39P56656 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Cyp2c39P56656 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cyp2c39P56656 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cyp2c39P56656 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cyp2c39P56656 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cyp2c39P56656 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cyp2c39P56656 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cyp2c39P56656 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Cyp2c39P56656 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Cyp2c39P56656 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cyp2c39P56656 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cyp2c39P56656 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cyp2c39P56656 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cyp2c39P56656 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cyp2c39P56656 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cyp2c39P56656 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cyp2c39P56656 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Cyp2c39P56656 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cyp2c39P56656 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.43
Cyp2c39P56656 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cyp2c39P56656 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cyp2c39P56656 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cyp2c39P56656 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms