Protein–RNA interactions for Protein: P56394

Cox17, Cytochrome c oxidase copper chaperone, mousemouse

Predictions only

Length 63 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox17P56394 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cox17P56394 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cox17P56394 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cox17P56394 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cox17P56394 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cox17P56394 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cox17P56394 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cox17P56394 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cox17P56394 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cox17P56394 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cox17P56394 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cox17P56394 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cox17P56394 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cox17P56394 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cox17P56394 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cox17P56394 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cox17P56394 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cox17P56394 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cox17P56394 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cox17P56394 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cox17P56394 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cox17P56394 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cox17P56394 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cox17P56394 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cox17P56394 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cox17P56394 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cox17P56394 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cox17P56394 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cox17P56394 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cox17P56394 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cox17P56394 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cox17P56394 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cox17P56394 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cox17P56394 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cox17P56394 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cox17P56394 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cox17P56394 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cox17P56394 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cox17P56394 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cox17P56394 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cox17P56394 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cox17P56394 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cox17P56394 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cox17P56394 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cox17P56394 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cox17P56394 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cox17P56394 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cox17P56394 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cox17P56394 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cox17P56394 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cox17P56394 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cox17P56394 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cox17P56394 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cox17P56394 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cox17P56394 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cox17P56394 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cox17P56394 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cox17P56394 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cox17P56394 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cox17P56394 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cox17P56394 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cox17P56394 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cox17P56394 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cox17P56394 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cox17P56394 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cox17P56394 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cox17P56394 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cox17P56394 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cox17P56394 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cox17P56394 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cox17P56394 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cox17P56394 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cox17P56394 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cox17P56394 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cox17P56394 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cox17P56394 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cox17P56394 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cox17P56394 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cox17P56394 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cox17P56394 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cox17P56394 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cox17P56394 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cox17P56394 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cox17P56394 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cox17P56394 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cox17P56394 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cox17P56394 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cox17P56394 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cox17P56394 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cox17P56394 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cox17P56394 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cox17P56394 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cox17P56394 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cox17P56394 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cox17P56394 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cox17P56394 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cox17P56394 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cox17P56394 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cox17P56394 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cox17P56394 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms