Protein–RNA interactions for Protein: P53994

Rab2a, Ras-related protein Rab-2A, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab2aP53994 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab2aP53994 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab2aP53994 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab2aP53994 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab2aP53994 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab2aP53994 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab2aP53994 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab2aP53994 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab2aP53994 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab2aP53994 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab2aP53994 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab2aP53994 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab2aP53994 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab2aP53994 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab2aP53994 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab2aP53994 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab2aP53994 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab2aP53994 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab2aP53994 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab2aP53994 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab2aP53994 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab2aP53994 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab2aP53994 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab2aP53994 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab2aP53994 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab2aP53994 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab2aP53994 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab2aP53994 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab2aP53994 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab2aP53994 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab2aP53994 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab2aP53994 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab2aP53994 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rab2aP53994 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rab2aP53994 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rab2aP53994 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rab2aP53994 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rab2aP53994 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rab2aP53994 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rab2aP53994 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab2aP53994 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab2aP53994 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab2aP53994 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab2aP53994 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab2aP53994 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab2aP53994 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab2aP53994 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab2aP53994 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab2aP53994 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab2aP53994 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab2aP53994 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab2aP53994 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab2aP53994 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab2aP53994 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab2aP53994 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab2aP53994 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab2aP53994 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab2aP53994 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab2aP53994 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab2aP53994 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab2aP53994 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab2aP53994 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab2aP53994 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab2aP53994 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab2aP53994 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab2aP53994 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab2aP53994 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab2aP53994 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab2aP53994 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab2aP53994 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab2aP53994 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab2aP53994 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab2aP53994 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab2aP53994 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab2aP53994 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab2aP53994 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rab2aP53994 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rab2aP53994 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rab2aP53994 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rab2aP53994 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rab2aP53994 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rab2aP53994 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rab2aP53994 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab2aP53994 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab2aP53994 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab2aP53994 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab2aP53994 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab2aP53994 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab2aP53994 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab2aP53994 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab2aP53994 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab2aP53994 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab2aP53994 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab2aP53994 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab2aP53994 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab2aP53994 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab2aP53994 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab2aP53994 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab2aP53994 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab2aP53994 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms