Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Apobec1P51908 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Apobec1P51908 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Apobec1P51908 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Apobec1P51908 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Apobec1P51908 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Apobec1P51908 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Apobec1P51908 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Apobec1P51908 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Apobec1P51908 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Apobec1P51908 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Apobec1P51908 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Apobec1P51908 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Apobec1P51908 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Apobec1P51908 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Apobec1P51908 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Apobec1P51908 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Apobec1P51908 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Apobec1P51908 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Apobec1P51908 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Apobec1P51908 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Apobec1P51908 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Apobec1P51908 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Apobec1P51908 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Apobec1P51908 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Apobec1P51908 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Apobec1P51908 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Apobec1P51908 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Apobec1P51908 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Apobec1P51908 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Apobec1P51908 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Apobec1P51908 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Apobec1P51908 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Apobec1P51908 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Apobec1P51908 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Apobec1P51908 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Apobec1P51908 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Apobec1P51908 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Apobec1P51908 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Apobec1P51908 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Apobec1P51908 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Apobec1P51908 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Apobec1P51908 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Apobec1P51908 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Apobec1P51908 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Apobec1P51908 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Apobec1P51908 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Apobec1P51908 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Apobec1P51908 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Apobec1P51908 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Apobec1P51908 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Apobec1P51908 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Apobec1P51908 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Apobec1P51908 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Apobec1P51908 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Apobec1P51908 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Apobec1P51908 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Apobec1P51908 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Apobec1P51908 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Apobec1P51908 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Apobec1P51908 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Apobec1P51908 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Apobec1P51908 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Apobec1P51908 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Apobec1P51908 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Apobec1P51908 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Apobec1P51908 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Apobec1P51908 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Apobec1P51908 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Apobec1P51908 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Apobec1P51908 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Apobec1P51908 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Apobec1P51908 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Apobec1P51908 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Apobec1P51908 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Apobec1P51908 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Apobec1P51908 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Apobec1P51908 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Apobec1P51908 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Apobec1P51908 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Apobec1P51908 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Apobec1P51908 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Apobec1P51908 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Apobec1P51908 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Apobec1P51908 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Apobec1P51908 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Apobec1P51908 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Apobec1P51908 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Apobec1P51908 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Apobec1P51908 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Apobec1P51908 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Apobec1P51908 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Apobec1P51908 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Apobec1P51908 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Apobec1P51908 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Apobec1P51908 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Apobec1P51908 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Apobec1P51908 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Apobec1P51908 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Apobec1P51908 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms