Protein–RNA interactions for Protein: P51906

Slc1a1, Excitatory amino acid transporter 3, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc1a1P51906 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Slc1a1P51906 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Slc1a1P51906 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc1a1P51906 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc1a1P51906 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc1a1P51906 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc1a1P51906 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc1a1P51906 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc1a1P51906 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc1a1P51906 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc1a1P51906 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc1a1P51906 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc1a1P51906 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc1a1P51906 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc1a1P51906 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc1a1P51906 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc1a1P51906 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc1a1P51906 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc1a1P51906 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc1a1P51906 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc1a1P51906 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc1a1P51906 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc1a1P51906 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc1a1P51906 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc1a1P51906 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc1a1P51906 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc1a1P51906 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc1a1P51906 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc1a1P51906 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc1a1P51906 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc1a1P51906 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc1a1P51906 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc1a1P51906 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc1a1P51906 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc1a1P51906 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc1a1P51906 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc1a1P51906 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc1a1P51906 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Slc1a1P51906 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc1a1P51906 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc1a1P51906 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc1a1P51906 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc1a1P51906 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc1a1P51906 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc1a1P51906 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc1a1P51906 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc1a1P51906 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc1a1P51906 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc1a1P51906 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc1a1P51906 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc1a1P51906 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc1a1P51906 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc1a1P51906 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc1a1P51906 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc1a1P51906 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc1a1P51906 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc1a1P51906 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc1a1P51906 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc1a1P51906 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc1a1P51906 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc1a1P51906 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc1a1P51906 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc1a1P51906 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc1a1P51906 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc1a1P51906 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc1a1P51906 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc1a1P51906 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc1a1P51906 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc1a1P51906 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc1a1P51906 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc1a1P51906 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc1a1P51906 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc1a1P51906 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc1a1P51906 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc1a1P51906 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc1a1P51906 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc1a1P51906 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc1a1P51906 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc1a1P51906 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc1a1P51906 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc1a1P51906 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc1a1P51906 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc1a1P51906 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Slc1a1P51906 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Slc1a1P51906 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc1a1P51906 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc1a1P51906 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc1a1P51906 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc1a1P51906 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc1a1P51906 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc1a1P51906 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc1a1P51906 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc1a1P51906 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc1a1P51906 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc1a1P51906 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc1a1P51906 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc1a1P51906 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc1a1P51906 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc1a1P51906 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc1a1P51906 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms