Protein–RNA interactions for Protein: P51791

Clcn3, H(+)/Cl(-) exchange transporter 3, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn3P51791 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Clcn3P51791 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Clcn3P51791 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Clcn3P51791 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Clcn3P51791 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Clcn3P51791 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Clcn3P51791 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Clcn3P51791 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Clcn3P51791 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Clcn3P51791 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Clcn3P51791 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Clcn3P51791 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Clcn3P51791 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Clcn3P51791 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Clcn3P51791 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Clcn3P51791 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Clcn3P51791 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Clcn3P51791 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Clcn3P51791 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Clcn3P51791 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Clcn3P51791 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Clcn3P51791 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Clcn3P51791 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Clcn3P51791 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Clcn3P51791 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Clcn3P51791 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Clcn3P51791 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Clcn3P51791 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Clcn3P51791 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Clcn3P51791 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Clcn3P51791 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Clcn3P51791 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Clcn3P51791 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Clcn3P51791 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Clcn3P51791 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Clcn3P51791 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Clcn3P51791 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Clcn3P51791 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Clcn3P51791 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Clcn3P51791 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Clcn3P51791 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Clcn3P51791 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Clcn3P51791 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Clcn3P51791 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Clcn3P51791 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Clcn3P51791 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Clcn3P51791 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Clcn3P51791 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Clcn3P51791 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Clcn3P51791 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Clcn3P51791 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Clcn3P51791 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Clcn3P51791 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Clcn3P51791 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Clcn3P51791 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Clcn3P51791 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Clcn3P51791 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Clcn3P51791 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Clcn3P51791 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Clcn3P51791 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Clcn3P51791 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Clcn3P51791 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Clcn3P51791 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Clcn3P51791 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Clcn3P51791 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Clcn3P51791 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Clcn3P51791 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Clcn3P51791 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Clcn3P51791 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Clcn3P51791 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Clcn3P51791 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Clcn3P51791 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Clcn3P51791 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Clcn3P51791 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Clcn3P51791 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Clcn3P51791 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Clcn3P51791 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Clcn3P51791 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Clcn3P51791 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Clcn3P51791 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Clcn3P51791 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Clcn3P51791 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Clcn3P51791 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Clcn3P51791 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Clcn3P51791 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Clcn3P51791 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Clcn3P51791 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Clcn3P51791 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Clcn3P51791 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Clcn3P51791 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Clcn3P51791 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Clcn3P51791 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Clcn3P51791 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Clcn3P51791 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Clcn3P51791 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Clcn3P51791 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Clcn3P51791 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Clcn3P51791 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Clcn3P51791 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Clcn3P51791 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms