Protein–RNA interactions for Protein: P51125

Cast, Calpastatin, mousemouse

Predictions only

Length 788 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CastP51125 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CastP51125 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CastP51125 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CastP51125 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CastP51125 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CastP51125 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CastP51125 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CastP51125 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CastP51125 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CastP51125 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CastP51125 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CastP51125 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CastP51125 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CastP51125 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CastP51125 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CastP51125 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CastP51125 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CastP51125 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CastP51125 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CastP51125 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CastP51125 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CastP51125 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CastP51125 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CastP51125 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CastP51125 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CastP51125 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CastP51125 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CastP51125 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CastP51125 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CastP51125 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CastP51125 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CastP51125 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CastP51125 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CastP51125 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CastP51125 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CastP51125 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CastP51125 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CastP51125 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CastP51125 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CastP51125 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CastP51125 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CastP51125 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CastP51125 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CastP51125 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CastP51125 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CastP51125 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CastP51125 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CastP51125 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CastP51125 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CastP51125 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CastP51125 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CastP51125 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CastP51125 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CastP51125 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CastP51125 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CastP51125 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CastP51125 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CastP51125 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CastP51125 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CastP51125 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CastP51125 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CastP51125 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CastP51125 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CastP51125 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CastP51125 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CastP51125 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CastP51125 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CastP51125 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CastP51125 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CastP51125 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CastP51125 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
CastP51125 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CastP51125 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CastP51125 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CastP51125 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CastP51125 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CastP51125 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CastP51125 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CastP51125 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CastP51125 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CastP51125 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CastP51125 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CastP51125 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CastP51125 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CastP51125 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CastP51125 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CastP51125 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CastP51125 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CastP51125 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CastP51125 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CastP51125 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CastP51125 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CastP51125 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CastP51125 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CastP51125 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CastP51125 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CastP51125 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CastP51125 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CastP51125 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CastP51125 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms