Protein–RNA interactions for Protein: P50752

Tnnt2, Troponin T, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt2P50752 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tnnt2P50752 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tnnt2P50752 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tnnt2P50752 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tnnt2P50752 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tnnt2P50752 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tnnt2P50752 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tnnt2P50752 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tnnt2P50752 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tnnt2P50752 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tnnt2P50752 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tnnt2P50752 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tnnt2P50752 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tnnt2P50752 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tnnt2P50752 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tnnt2P50752 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tnnt2P50752 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tnnt2P50752 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tnnt2P50752 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tnnt2P50752 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tnnt2P50752 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tnnt2P50752 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tnnt2P50752 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tnnt2P50752 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tnnt2P50752 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tnnt2P50752 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tnnt2P50752 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tnnt2P50752 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tnnt2P50752 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tnnt2P50752 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tnnt2P50752 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tnnt2P50752 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tnnt2P50752 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tnnt2P50752 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tnnt2P50752 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tnnt2P50752 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tnnt2P50752 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tnnt2P50752 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tnnt2P50752 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tnnt2P50752 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tnnt2P50752 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tnnt2P50752 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tnnt2P50752 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Tnnt2P50752 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Tnnt2P50752 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tnnt2P50752 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tnnt2P50752 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tnnt2P50752 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tnnt2P50752 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tnnt2P50752 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tnnt2P50752 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tnnt2P50752 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tnnt2P50752 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tnnt2P50752 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tnnt2P50752 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tnnt2P50752 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Tnnt2P50752 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tnnt2P50752 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tnnt2P50752 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tnnt2P50752 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Tnnt2P50752 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Tnnt2P50752 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tnnt2P50752 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tnnt2P50752 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tnnt2P50752 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tnnt2P50752 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tnnt2P50752 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tnnt2P50752 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tnnt2P50752 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tnnt2P50752 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Tnnt2P50752 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tnnt2P50752 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tnnt2P50752 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Tnnt2P50752 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tnnt2P50752 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tnnt2P50752 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tnnt2P50752 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tnnt2P50752 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tnnt2P50752 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tnnt2P50752 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tnnt2P50752 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tnnt2P50752 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tnnt2P50752 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tnnt2P50752 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tnnt2P50752 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Tnnt2P50752 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Tnnt2P50752 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tnnt2P50752 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tnnt2P50752 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tnnt2P50752 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tnnt2P50752 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tnnt2P50752 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Tnnt2P50752 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tnnt2P50752 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tnnt2P50752 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tnnt2P50752 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Tnnt2P50752 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tnnt2P50752 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tnnt2P50752 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tnnt2P50752 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms