Protein–RNA interactions for Protein: P50431

Shmt1, Serine hydroxymethyltransferase, cytosolic, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shmt1P50431 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Shmt1P50431 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Shmt1P50431 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Shmt1P50431 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Shmt1P50431 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Shmt1P50431 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Shmt1P50431 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Shmt1P50431 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Shmt1P50431 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Shmt1P50431 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Shmt1P50431 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Shmt1P50431 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Shmt1P50431 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Shmt1P50431 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Shmt1P50431 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Shmt1P50431 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Shmt1P50431 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Shmt1P50431 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Shmt1P50431 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Shmt1P50431 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Shmt1P50431 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Shmt1P50431 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Shmt1P50431 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Shmt1P50431 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Shmt1P50431 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Shmt1P50431 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Shmt1P50431 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Shmt1P50431 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Shmt1P50431 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Shmt1P50431 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Shmt1P50431 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Shmt1P50431 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Shmt1P50431 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Shmt1P50431 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Shmt1P50431 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Shmt1P50431 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Shmt1P50431 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Shmt1P50431 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Shmt1P50431 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Shmt1P50431 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Shmt1P50431 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Shmt1P50431 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Shmt1P50431 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Shmt1P50431 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Shmt1P50431 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Shmt1P50431 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Shmt1P50431 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Shmt1P50431 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Shmt1P50431 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Shmt1P50431 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Shmt1P50431 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Shmt1P50431 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Shmt1P50431 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Shmt1P50431 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Shmt1P50431 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Shmt1P50431 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Shmt1P50431 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Shmt1P50431 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Shmt1P50431 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Shmt1P50431 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Shmt1P50431 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Shmt1P50431 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Shmt1P50431 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Shmt1P50431 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Shmt1P50431 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Shmt1P50431 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Shmt1P50431 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Shmt1P50431 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Shmt1P50431 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Shmt1P50431 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Shmt1P50431 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Shmt1P50431 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Shmt1P50431 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Shmt1P50431 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Shmt1P50431 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Shmt1P50431 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Shmt1P50431 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Shmt1P50431 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Shmt1P50431 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Shmt1P50431 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Shmt1P50431 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Shmt1P50431 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Shmt1P50431 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Shmt1P50431 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Shmt1P50431 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Shmt1P50431 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Shmt1P50431 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Shmt1P50431 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Shmt1P50431 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Shmt1P50431 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Shmt1P50431 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Shmt1P50431 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Shmt1P50431 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Shmt1P50431 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Shmt1P50431 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Shmt1P50431 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Shmt1P50431 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Shmt1P50431 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Shmt1P50431 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Shmt1P50431 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms