Protein–RNA interactions for Protein: P49817

Cav1, Caveolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cav1P49817 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cav1P49817 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cav1P49817 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Cav1P49817 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cav1P49817 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cav1P49817 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cav1P49817 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cav1P49817 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cav1P49817 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cav1P49817 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cav1P49817 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cav1P49817 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cav1P49817 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cav1P49817 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cav1P49817 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cav1P49817 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Cav1P49817 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cav1P49817 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cav1P49817 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cav1P49817 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cav1P49817 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cav1P49817 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cav1P49817 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cav1P49817 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cav1P49817 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cav1P49817 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Cav1P49817 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Cav1P49817 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cav1P49817 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cav1P49817 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Cav1P49817 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cav1P49817 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cav1P49817 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cav1P49817 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Cav1P49817 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cav1P49817 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Cav1P49817 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cav1P49817 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cav1P49817 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cav1P49817 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cav1P49817 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cav1P49817 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cav1P49817 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cav1P49817 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cav1P49817 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cav1P49817 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cav1P49817 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cav1P49817 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cav1P49817 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cav1P49817 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cav1P49817 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cav1P49817 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cav1P49817 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cav1P49817 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cav1P49817 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cav1P49817 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cav1P49817 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cav1P49817 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cav1P49817 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cav1P49817 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cav1P49817 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cav1P49817 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cav1P49817 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cav1P49817 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cav1P49817 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cav1P49817 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cav1P49817 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cav1P49817 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cav1P49817 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cav1P49817 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cav1P49817 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cav1P49817 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cav1P49817 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cav1P49817 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cav1P49817 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cav1P49817 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cav1P49817 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cav1P49817 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cav1P49817 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cav1P49817 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cav1P49817 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cav1P49817 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cav1P49817 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cav1P49817 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cav1P49817 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cav1P49817 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cav1P49817 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cav1P49817 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cav1P49817 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cav1P49817 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cav1P49817 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cav1P49817 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cav1P49817 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cav1P49817 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cav1P49817 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cav1P49817 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cav1P49817 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cav1P49817 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cav1P49817 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cav1P49817 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms