Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PtpreP49446 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PtpreP49446 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PtpreP49446 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PtpreP49446 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PtpreP49446 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PtpreP49446 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PtpreP49446 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PtpreP49446 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PtpreP49446 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PtpreP49446 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PtpreP49446 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PtpreP49446 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PtpreP49446 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PtpreP49446 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PtpreP49446 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PtpreP49446 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PtpreP49446 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PtpreP49446 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PtpreP49446 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PtpreP49446 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PtpreP49446 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PtpreP49446 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PtpreP49446 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PtpreP49446 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PtpreP49446 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PtpreP49446 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PtpreP49446 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PtpreP49446 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PtpreP49446 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PtpreP49446 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PtpreP49446 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PtpreP49446 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PtpreP49446 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PtpreP49446 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PtpreP49446 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PtpreP49446 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PtpreP49446 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PtpreP49446 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PtpreP49446 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PtpreP49446 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PtpreP49446 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PtpreP49446 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PtpreP49446 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PtpreP49446 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PtpreP49446 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PtpreP49446 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PtpreP49446 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PtpreP49446 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PtpreP49446 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PtpreP49446 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PtpreP49446 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PtpreP49446 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PtpreP49446 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PtpreP49446 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PtpreP49446 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PtpreP49446 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PtpreP49446 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PtpreP49446 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PtpreP49446 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PtpreP49446 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PtpreP49446 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PtpreP49446 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PtpreP49446 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PtpreP49446 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PtpreP49446 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PtpreP49446 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PtpreP49446 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PtpreP49446 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PtpreP49446 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PtpreP49446 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PtpreP49446 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PtpreP49446 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PtpreP49446 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PtpreP49446 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PtpreP49446 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PtpreP49446 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PtpreP49446 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PtpreP49446 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PtpreP49446 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PtpreP49446 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PtpreP49446 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PtpreP49446 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PtpreP49446 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PtpreP49446 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PtpreP49446 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PtpreP49446 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PtpreP49446 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PtpreP49446 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PtpreP49446 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PtpreP49446 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PtpreP49446 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PtpreP49446 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PtpreP49446 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PtpreP49446 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PtpreP49446 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PtpreP49446 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PtpreP49446 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PtpreP49446 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PtpreP49446 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
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