Protein–RNA interactions for Protein: P49222

Epb42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, mousemouse

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb42P49222 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Epb42P49222 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Epb42P49222 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Epb42P49222 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Epb42P49222 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Epb42P49222 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Epb42P49222 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Epb42P49222 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Epb42P49222 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Epb42P49222 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Epb42P49222 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Epb42P49222 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Epb42P49222 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Epb42P49222 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Epb42P49222 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Epb42P49222 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Epb42P49222 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Epb42P49222 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Epb42P49222 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Epb42P49222 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Epb42P49222 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Epb42P49222 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Epb42P49222 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Epb42P49222 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Epb42P49222 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Epb42P49222 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Epb42P49222 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Epb42P49222 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Epb42P49222 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Epb42P49222 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Epb42P49222 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Epb42P49222 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Epb42P49222 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Epb42P49222 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Epb42P49222 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Epb42P49222 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Epb42P49222 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Epb42P49222 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Epb42P49222 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Epb42P49222 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Epb42P49222 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Epb42P49222 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Epb42P49222 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Epb42P49222 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Epb42P49222 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Epb42P49222 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Epb42P49222 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Epb42P49222 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Epb42P49222 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Epb42P49222 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Epb42P49222 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Epb42P49222 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Epb42P49222 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Epb42P49222 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Epb42P49222 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Epb42P49222 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Epb42P49222 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Epb42P49222 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Epb42P49222 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Epb42P49222 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Epb42P49222 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Epb42P49222 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Epb42P49222 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Epb42P49222 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Epb42P49222 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Epb42P49222 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Epb42P49222 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Epb42P49222 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Epb42P49222 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Epb42P49222 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Epb42P49222 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Epb42P49222 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Epb42P49222 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Epb42P49222 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Epb42P49222 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Epb42P49222 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Epb42P49222 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Epb42P49222 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Epb42P49222 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Epb42P49222 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Epb42P49222 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Epb42P49222 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Epb42P49222 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Epb42P49222 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Epb42P49222 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Epb42P49222 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Epb42P49222 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Epb42P49222 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Epb42P49222 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Epb42P49222 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Epb42P49222 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Epb42P49222 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Epb42P49222 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Epb42P49222 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Epb42P49222 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Epb42P49222 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Epb42P49222 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Epb42P49222 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Epb42P49222 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Epb42P49222 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms