Protein–RNA interactions for Protein: P48428

Tbca, Tubulin-specific chaperone A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 108 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TbcaP48428 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TbcaP48428 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TbcaP48428 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TbcaP48428 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TbcaP48428 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TbcaP48428 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TbcaP48428 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TbcaP48428 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TbcaP48428 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TbcaP48428 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TbcaP48428 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TbcaP48428 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TbcaP48428 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TbcaP48428 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TbcaP48428 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TbcaP48428 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TbcaP48428 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TbcaP48428 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TbcaP48428 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TbcaP48428 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TbcaP48428 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TbcaP48428 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TbcaP48428 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TbcaP48428 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TbcaP48428 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TbcaP48428 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TbcaP48428 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TbcaP48428 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TbcaP48428 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TbcaP48428 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TbcaP48428 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TbcaP48428 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TbcaP48428 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TbcaP48428 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TbcaP48428 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TbcaP48428 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TbcaP48428 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TbcaP48428 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TbcaP48428 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TbcaP48428 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TbcaP48428 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TbcaP48428 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TbcaP48428 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TbcaP48428 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TbcaP48428 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TbcaP48428 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TbcaP48428 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TbcaP48428 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TbcaP48428 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TbcaP48428 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TbcaP48428 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TbcaP48428 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TbcaP48428 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TbcaP48428 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TbcaP48428 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TbcaP48428 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TbcaP48428 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TbcaP48428 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TbcaP48428 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TbcaP48428 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TbcaP48428 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TbcaP48428 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TbcaP48428 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TbcaP48428 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TbcaP48428 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TbcaP48428 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TbcaP48428 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TbcaP48428 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TbcaP48428 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TbcaP48428 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TbcaP48428 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TbcaP48428 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TbcaP48428 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TbcaP48428 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TbcaP48428 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TbcaP48428 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TbcaP48428 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TbcaP48428 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TbcaP48428 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TbcaP48428 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TbcaP48428 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TbcaP48428 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TbcaP48428 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TbcaP48428 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TbcaP48428 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TbcaP48428 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TbcaP48428 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TbcaP48428 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TbcaP48428 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TbcaP48428 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TbcaP48428 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TbcaP48428 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TbcaP48428 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TbcaP48428 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TbcaP48428 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TbcaP48428 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TbcaP48428 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TbcaP48428 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TbcaP48428 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TbcaP48428 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
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