Protein–RNA interactions for Protein: P48379

Rfx2, DNA-binding protein RFX2, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx2P48379 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rfx2P48379 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rfx2P48379 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rfx2P48379 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rfx2P48379 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rfx2P48379 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rfx2P48379 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Rfx2P48379 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rfx2P48379 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rfx2P48379 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rfx2P48379 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rfx2P48379 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rfx2P48379 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rfx2P48379 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rfx2P48379 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rfx2P48379 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rfx2P48379 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rfx2P48379 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rfx2P48379 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rfx2P48379 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rfx2P48379 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rfx2P48379 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rfx2P48379 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rfx2P48379 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rfx2P48379 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rfx2P48379 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Rfx2P48379 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rfx2P48379 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rfx2P48379 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rfx2P48379 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rfx2P48379 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rfx2P48379 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rfx2P48379 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rfx2P48379 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rfx2P48379 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rfx2P48379 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rfx2P48379 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rfx2P48379 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rfx2P48379 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rfx2P48379 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rfx2P48379 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rfx2P48379 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rfx2P48379 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Rfx2P48379 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rfx2P48379 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rfx2P48379 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rfx2P48379 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rfx2P48379 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rfx2P48379 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rfx2P48379 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rfx2P48379 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Rfx2P48379 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rfx2P48379 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rfx2P48379 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rfx2P48379 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rfx2P48379 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rfx2P48379 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rfx2P48379 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rfx2P48379 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rfx2P48379 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rfx2P48379 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Rfx2P48379 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rfx2P48379 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rfx2P48379 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Rfx2P48379 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Rfx2P48379 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rfx2P48379 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rfx2P48379 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rfx2P48379 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rfx2P48379 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rfx2P48379 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rfx2P48379 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rfx2P48379 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rfx2P48379 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rfx2P48379 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Rfx2P48379 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Rfx2P48379 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rfx2P48379 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rfx2P48379 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rfx2P48379 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rfx2P48379 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rfx2P48379 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rfx2P48379 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rfx2P48379 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rfx2P48379 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rfx2P48379 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rfx2P48379 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rfx2P48379 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rfx2P48379 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rfx2P48379 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rfx2P48379 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rfx2P48379 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rfx2P48379 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rfx2P48379 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rfx2P48379 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Rfx2P48379 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rfx2P48379 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rfx2P48379 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rfx2P48379 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rfx2P48379 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms