Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
VdrP48281 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VdrP48281 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VdrP48281 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
VdrP48281 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
VdrP48281 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
VdrP48281 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
VdrP48281 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
VdrP48281 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VdrP48281 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VdrP48281 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VdrP48281 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VdrP48281 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VdrP48281 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VdrP48281 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
VdrP48281 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VdrP48281 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VdrP48281 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VdrP48281 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
VdrP48281 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VdrP48281 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VdrP48281 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VdrP48281 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VdrP48281 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VdrP48281 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VdrP48281 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VdrP48281 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VdrP48281 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VdrP48281 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VdrP48281 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VdrP48281 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
VdrP48281 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VdrP48281 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VdrP48281 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VdrP48281 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VdrP48281 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
VdrP48281 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VdrP48281 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VdrP48281 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
VdrP48281 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VdrP48281 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VdrP48281 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VdrP48281 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VdrP48281 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VdrP48281 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
VdrP48281 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VdrP48281 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VdrP48281 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VdrP48281 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VdrP48281 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VdrP48281 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
VdrP48281 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VdrP48281 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VdrP48281 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VdrP48281 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VdrP48281 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VdrP48281 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VdrP48281 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VdrP48281 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VdrP48281 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VdrP48281 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VdrP48281 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
VdrP48281 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VdrP48281 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VdrP48281 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VdrP48281 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VdrP48281 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
VdrP48281 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VdrP48281 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VdrP48281 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VdrP48281 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VdrP48281 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VdrP48281 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VdrP48281 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VdrP48281 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VdrP48281 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VdrP48281 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VdrP48281 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VdrP48281 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VdrP48281 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VdrP48281 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VdrP48281 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VdrP48281 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VdrP48281 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
VdrP48281 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VdrP48281 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VdrP48281 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VdrP48281 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VdrP48281 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VdrP48281 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VdrP48281 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VdrP48281 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VdrP48281 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VdrP48281 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VdrP48281 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VdrP48281 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VdrP48281 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VdrP48281 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VdrP48281 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VdrP48281 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms