Protein–RNA interactions for Protein: P47939

Resp18, Regulated endocrine-specific protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Resp18P47939 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Resp18P47939 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Resp18P47939 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Resp18P47939 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Resp18P47939 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Resp18P47939 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Resp18P47939 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Resp18P47939 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Resp18P47939 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Resp18P47939 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Resp18P47939 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Resp18P47939 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Resp18P47939 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Resp18P47939 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Resp18P47939 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Resp18P47939 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Resp18P47939 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Resp18P47939 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Resp18P47939 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Resp18P47939 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Resp18P47939 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Resp18P47939 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Resp18P47939 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Resp18P47939 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Resp18P47939 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Resp18P47939 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Resp18P47939 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Resp18P47939 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Resp18P47939 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Resp18P47939 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Resp18P47939 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Resp18P47939 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Resp18P47939 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Resp18P47939 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Resp18P47939 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Resp18P47939 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Resp18P47939 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Resp18P47939 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Resp18P47939 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Resp18P47939 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Resp18P47939 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Resp18P47939 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Resp18P47939 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Resp18P47939 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Resp18P47939 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Resp18P47939 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Resp18P47939 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Resp18P47939 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Resp18P47939 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Resp18P47939 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Resp18P47939 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Resp18P47939 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Resp18P47939 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Resp18P47939 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Resp18P47939 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Resp18P47939 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Resp18P47939 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Resp18P47939 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Resp18P47939 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Resp18P47939 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Resp18P47939 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Resp18P47939 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Resp18P47939 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Resp18P47939 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Resp18P47939 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Resp18P47939 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Resp18P47939 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Resp18P47939 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Resp18P47939 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Resp18P47939 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Resp18P47939 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Resp18P47939 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Resp18P47939 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Resp18P47939 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Resp18P47939 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Resp18P47939 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Resp18P47939 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Resp18P47939 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Resp18P47939 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Resp18P47939 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Resp18P47939 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Resp18P47939 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Resp18P47939 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Resp18P47939 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Resp18P47939 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Resp18P47939 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Resp18P47939 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Resp18P47939 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Resp18P47939 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Resp18P47939 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Resp18P47939 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Resp18P47939 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Resp18P47939 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Resp18P47939 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Resp18P47939 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Resp18P47939 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Resp18P47939 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Resp18P47939 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Resp18P47939 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Resp18P47939 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms