Protein–RNA interactions for Protein: P47915

Rpl29, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl29P47915 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpl29P47915 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpl29P47915 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpl29P47915 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpl29P47915 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpl29P47915 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl29P47915 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl29P47915 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl29P47915 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl29P47915 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl29P47915 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpl29P47915 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpl29P47915 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpl29P47915 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpl29P47915 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpl29P47915 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpl29P47915 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpl29P47915 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpl29P47915 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpl29P47915 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpl29P47915 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpl29P47915 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpl29P47915 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpl29P47915 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpl29P47915 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpl29P47915 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpl29P47915 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpl29P47915 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpl29P47915 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpl29P47915 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpl29P47915 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpl29P47915 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpl29P47915 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpl29P47915 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpl29P47915 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpl29P47915 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpl29P47915 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpl29P47915 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpl29P47915 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpl29P47915 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpl29P47915 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpl29P47915 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpl29P47915 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpl29P47915 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpl29P47915 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpl29P47915 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpl29P47915 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpl29P47915 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpl29P47915 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpl29P47915 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpl29P47915 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpl29P47915 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpl29P47915 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpl29P47915 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpl29P47915 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpl29P47915 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpl29P47915 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpl29P47915 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpl29P47915 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpl29P47915 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpl29P47915 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpl29P47915 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpl29P47915 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpl29P47915 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpl29P47915 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rpl29P47915 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rpl29P47915 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rpl29P47915 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpl29P47915 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpl29P47915 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpl29P47915 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpl29P47915 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpl29P47915 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpl29P47915 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpl29P47915 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpl29P47915 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpl29P47915 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpl29P47915 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpl29P47915 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpl29P47915 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpl29P47915 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpl29P47915 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpl29P47915 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpl29P47915 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpl29P47915 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpl29P47915 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpl29P47915 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpl29P47915 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpl29P47915 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpl29P47915 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpl29P47915 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpl29P47915 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpl29P47915 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpl29P47915 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpl29P47915 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpl29P47915 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpl29P47915 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpl29P47915 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpl29P47915 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpl29P47915 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms