Protein–RNA interactions for Protein: P43029

Gdf7, Growth/differentiation factor 7, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf7P43029 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gdf7P43029 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gdf7P43029 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gdf7P43029 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gdf7P43029 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gdf7P43029 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gdf7P43029 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gdf7P43029 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gdf7P43029 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gdf7P43029 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gdf7P43029 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gdf7P43029 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gdf7P43029 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gdf7P43029 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gdf7P43029 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gdf7P43029 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gdf7P43029 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gdf7P43029 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gdf7P43029 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Gdf7P43029 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gdf7P43029 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gdf7P43029 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gdf7P43029 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gdf7P43029 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gdf7P43029 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gdf7P43029 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gdf7P43029 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gdf7P43029 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gdf7P43029 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gdf7P43029 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gdf7P43029 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gdf7P43029 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gdf7P43029 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Gdf7P43029 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gdf7P43029 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gdf7P43029 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gdf7P43029 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gdf7P43029 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Gdf7P43029 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gdf7P43029 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gdf7P43029 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gdf7P43029 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gdf7P43029 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gdf7P43029 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gdf7P43029 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Gdf7P43029 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gdf7P43029 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gdf7P43029 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gdf7P43029 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gdf7P43029 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gdf7P43029 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gdf7P43029 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gdf7P43029 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gdf7P43029 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gdf7P43029 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gdf7P43029 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gdf7P43029 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gdf7P43029 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gdf7P43029 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gdf7P43029 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gdf7P43029 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gdf7P43029 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gdf7P43029 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gdf7P43029 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gdf7P43029 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gdf7P43029 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gdf7P43029 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gdf7P43029 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gdf7P43029 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gdf7P43029 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gdf7P43029 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Gdf7P43029 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Gdf7P43029 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gdf7P43029 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gdf7P43029 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gdf7P43029 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gdf7P43029 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gdf7P43029 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gdf7P43029 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gdf7P43029 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gdf7P43029 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gdf7P43029 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gdf7P43029 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gdf7P43029 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gdf7P43029 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gdf7P43029 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gdf7P43029 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gdf7P43029 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gdf7P43029 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gdf7P43029 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gdf7P43029 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gdf7P43029 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gdf7P43029 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gdf7P43029 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gdf7P43029 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Gdf7P43029 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gdf7P43029 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gdf7P43029 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Gdf7P43029 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gdf7P43029 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms