Protein–RNA interactions for Protein: P40240

Cd9, CD9 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd9P40240 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cd9P40240 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cd9P40240 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cd9P40240 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cd9P40240 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cd9P40240 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Cd9P40240 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cd9P40240 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cd9P40240 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cd9P40240 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cd9P40240 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cd9P40240 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cd9P40240 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cd9P40240 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cd9P40240 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cd9P40240 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cd9P40240 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cd9P40240 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cd9P40240 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cd9P40240 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cd9P40240 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cd9P40240 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Cd9P40240 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cd9P40240 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cd9P40240 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cd9P40240 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cd9P40240 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cd9P40240 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cd9P40240 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cd9P40240 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cd9P40240 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cd9P40240 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cd9P40240 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cd9P40240 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cd9P40240 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cd9P40240 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cd9P40240 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cd9P40240 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cd9P40240 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cd9P40240 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cd9P40240 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cd9P40240 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cd9P40240 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cd9P40240 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Cd9P40240 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cd9P40240 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cd9P40240 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cd9P40240 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cd9P40240 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cd9P40240 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Cd9P40240 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cd9P40240 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cd9P40240 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cd9P40240 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cd9P40240 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cd9P40240 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cd9P40240 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cd9P40240 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cd9P40240 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cd9P40240 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cd9P40240 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cd9P40240 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cd9P40240 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cd9P40240 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cd9P40240 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cd9P40240 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cd9P40240 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cd9P40240 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cd9P40240 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cd9P40240 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cd9P40240 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cd9P40240 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cd9P40240 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cd9P40240 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cd9P40240 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cd9P40240 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cd9P40240 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cd9P40240 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cd9P40240 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cd9P40240 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cd9P40240 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cd9P40240 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cd9P40240 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cd9P40240 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cd9P40240 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cd9P40240 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Cd9P40240 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cd9P40240 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cd9P40240 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cd9P40240 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cd9P40240 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cd9P40240 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cd9P40240 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cd9P40240 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cd9P40240 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cd9P40240 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cd9P40240 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cd9P40240 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Cd9P40240 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cd9P40240 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.8 ms