Protein–RNA interactions for Protein: P39876

Timp3, Metalloproteinase inhibitor 3, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timp3P39876 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Timp3P39876 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Timp3P39876 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Timp3P39876 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Timp3P39876 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Timp3P39876 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Timp3P39876 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Timp3P39876 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Timp3P39876 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Timp3P39876 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Timp3P39876 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Timp3P39876 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Timp3P39876 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Timp3P39876 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Timp3P39876 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Timp3P39876 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Timp3P39876 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Timp3P39876 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Timp3P39876 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Timp3P39876 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Timp3P39876 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Timp3P39876 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Timp3P39876 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Timp3P39876 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Timp3P39876 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Timp3P39876 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Timp3P39876 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Timp3P39876 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Timp3P39876 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Timp3P39876 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Timp3P39876 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Timp3P39876 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Timp3P39876 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Timp3P39876 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Timp3P39876 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Timp3P39876 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Timp3P39876 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Timp3P39876 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Timp3P39876 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Timp3P39876 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Timp3P39876 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Timp3P39876 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Timp3P39876 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Timp3P39876 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Timp3P39876 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Timp3P39876 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Timp3P39876 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Timp3P39876 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Timp3P39876 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Timp3P39876 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Timp3P39876 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Timp3P39876 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Timp3P39876 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Timp3P39876 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Timp3P39876 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Timp3P39876 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Timp3P39876 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Timp3P39876 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Timp3P39876 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Timp3P39876 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Timp3P39876 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Timp3P39876 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Timp3P39876 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Timp3P39876 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Timp3P39876 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Timp3P39876 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Timp3P39876 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Timp3P39876 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Timp3P39876 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Timp3P39876 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Timp3P39876 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Timp3P39876 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Timp3P39876 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Timp3P39876 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Timp3P39876 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Timp3P39876 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Timp3P39876 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Timp3P39876 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Timp3P39876 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Timp3P39876 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Timp3P39876 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Timp3P39876 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Timp3P39876 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Timp3P39876 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Timp3P39876 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Timp3P39876 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Timp3P39876 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Timp3P39876 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Timp3P39876 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Timp3P39876 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Timp3P39876 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Timp3P39876 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Timp3P39876 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Timp3P39876 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Timp3P39876 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Timp3P39876 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Timp3P39876 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Timp3P39876 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Timp3P39876 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Timp3P39876 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms