Protein–RNA interactions for Protein: P37238

Pparg, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpargP37238 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PpargP37238 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PpargP37238 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PpargP37238 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PpargP37238 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PpargP37238 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PpargP37238 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PpargP37238 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PpargP37238 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PpargP37238 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PpargP37238 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PpargP37238 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PpargP37238 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PpargP37238 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PpargP37238 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PpargP37238 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PpargP37238 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PpargP37238 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
PpargP37238 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PpargP37238 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PpargP37238 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PpargP37238 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PpargP37238 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PpargP37238 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PpargP37238 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PpargP37238 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PpargP37238 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PpargP37238 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PpargP37238 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PpargP37238 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PpargP37238 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PpargP37238 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PpargP37238 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PpargP37238 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PpargP37238 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PpargP37238 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PpargP37238 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PpargP37238 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PpargP37238 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PpargP37238 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PpargP37238 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PpargP37238 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PpargP37238 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PpargP37238 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PpargP37238 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PpargP37238 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PpargP37238 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PpargP37238 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PpargP37238 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PpargP37238 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PpargP37238 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PpargP37238 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PpargP37238 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PpargP37238 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PpargP37238 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PpargP37238 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PpargP37238 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PpargP37238 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PpargP37238 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PpargP37238 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PpargP37238 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PpargP37238 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PpargP37238 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PpargP37238 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PpargP37238 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PpargP37238 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PpargP37238 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PpargP37238 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PpargP37238 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PpargP37238 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PpargP37238 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PpargP37238 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PpargP37238 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PpargP37238 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PpargP37238 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PpargP37238 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PpargP37238 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PpargP37238 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PpargP37238 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PpargP37238 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PpargP37238 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PpargP37238 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PpargP37238 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PpargP37238 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PpargP37238 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PpargP37238 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PpargP37238 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PpargP37238 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PpargP37238 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PpargP37238 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PpargP37238 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PpargP37238 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PpargP37238 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PpargP37238 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PpargP37238 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PpargP37238 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PpargP37238 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PpargP37238 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PpargP37238 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PpargP37238 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms