Protein–RNA interactions for Protein: P35969

Flt1, Vascular endothelial growth factor receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Flt1P35969 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Flt1P35969 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Flt1P35969 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Flt1P35969 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Flt1P35969 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Flt1P35969 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Flt1P35969 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Flt1P35969 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Flt1P35969 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Flt1P35969 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Flt1P35969 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Flt1P35969 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Flt1P35969 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Flt1P35969 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Flt1P35969 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Flt1P35969 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Flt1P35969 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Flt1P35969 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Flt1P35969 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Flt1P35969 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Flt1P35969 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Flt1P35969 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Flt1P35969 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Flt1P35969 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Flt1P35969 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Flt1P35969 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Flt1P35969 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Flt1P35969 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Flt1P35969 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Flt1P35969 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Flt1P35969 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Flt1P35969 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Flt1P35969 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Flt1P35969 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Flt1P35969 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Flt1P35969 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Flt1P35969 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Flt1P35969 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Flt1P35969 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Flt1P35969 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Flt1P35969 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Flt1P35969 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Flt1P35969 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Flt1P35969 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Flt1P35969 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Flt1P35969 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Flt1P35969 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Flt1P35969 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Flt1P35969 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Flt1P35969 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Flt1P35969 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Flt1P35969 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Flt1P35969 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Flt1P35969 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Flt1P35969 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Flt1P35969 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Flt1P35969 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Flt1P35969 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Flt1P35969 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
Flt1P35969 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Flt1P35969 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Flt1P35969 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Flt1P35969 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Flt1P35969 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Flt1P35969 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Flt1P35969 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Flt1P35969 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Flt1P35969 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Flt1P35969 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Flt1P35969 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Flt1P35969 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Flt1P35969 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Flt1P35969 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Flt1P35969 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Flt1P35969 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Flt1P35969 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Flt1P35969 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Flt1P35969 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Flt1P35969 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Flt1P35969 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Flt1P35969 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Flt1P35969 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Flt1P35969 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Flt1P35969 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Flt1P35969 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Flt1P35969 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Flt1P35969 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Flt1P35969 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Flt1P35969 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Flt1P35969 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Flt1P35969 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Flt1P35969 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Flt1P35969 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Flt1P35969 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Flt1P35969 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Flt1P35969 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Flt1P35969 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Flt1P35969 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Flt1P35969 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Flt1P35969 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms