Protein–RNA interactions for Protein: P35689

Ercc5, DNA repair protein complementing XP-G cells homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc5P35689 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ercc5P35689 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ercc5P35689 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ercc5P35689 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ercc5P35689 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ercc5P35689 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ercc5P35689 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ercc5P35689 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ercc5P35689 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ercc5P35689 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ercc5P35689 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ercc5P35689 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ercc5P35689 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ercc5P35689 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ercc5P35689 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ercc5P35689 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Ercc5P35689 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ercc5P35689 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ercc5P35689 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ercc5P35689 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ercc5P35689 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ercc5P35689 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ercc5P35689 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ercc5P35689 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ercc5P35689 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ercc5P35689 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ercc5P35689 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ercc5P35689 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ercc5P35689 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ercc5P35689 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ercc5P35689 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ercc5P35689 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ercc5P35689 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ercc5P35689 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ercc5P35689 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ercc5P35689 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ercc5P35689 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ercc5P35689 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ercc5P35689 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ercc5P35689 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ercc5P35689 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ercc5P35689 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ercc5P35689 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ercc5P35689 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ercc5P35689 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ercc5P35689 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ercc5P35689 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ercc5P35689 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ercc5P35689 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ercc5P35689 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ercc5P35689 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ercc5P35689 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ercc5P35689 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ercc5P35689 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ercc5P35689 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ercc5P35689 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ercc5P35689 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ercc5P35689 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ercc5P35689 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ercc5P35689 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ercc5P35689 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ercc5P35689 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ercc5P35689 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ercc5P35689 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ercc5P35689 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ercc5P35689 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ercc5P35689 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ercc5P35689 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ercc5P35689 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ercc5P35689 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ercc5P35689 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ercc5P35689 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ercc5P35689 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ercc5P35689 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ercc5P35689 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ercc5P35689 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ercc5P35689 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ercc5P35689 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ercc5P35689 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ercc5P35689 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ercc5P35689 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ercc5P35689 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ercc5P35689 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ercc5P35689 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ercc5P35689 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ercc5P35689 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ercc5P35689 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ercc5P35689 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ercc5P35689 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ercc5P35689 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ercc5P35689 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ercc5P35689 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ercc5P35689 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ercc5P35689 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ercc5P35689 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ercc5P35689 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ercc5P35689 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ercc5P35689 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ercc5P35689 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ercc5P35689 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms