Protein–RNA interactions for Protein: P35175

Stfa1, Stefin-1, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stfa1P35175 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stfa1P35175 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stfa1P35175 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stfa1P35175 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stfa1P35175 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stfa1P35175 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stfa1P35175 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stfa1P35175 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stfa1P35175 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stfa1P35175 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stfa1P35175 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Stfa1P35175 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Stfa1P35175 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Stfa1P35175 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Stfa1P35175 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Stfa1P35175 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Stfa1P35175 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Stfa1P35175 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Stfa1P35175 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Stfa1P35175 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Stfa1P35175 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Stfa1P35175 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Stfa1P35175 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Stfa1P35175 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Stfa1P35175 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Stfa1P35175 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Stfa1P35175 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Stfa1P35175 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Stfa1P35175 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Stfa1P35175 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Stfa1P35175 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Stfa1P35175 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Stfa1P35175 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Stfa1P35175 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Stfa1P35175 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Stfa1P35175 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Stfa1P35175 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Stfa1P35175 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Stfa1P35175 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Stfa1P35175 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Stfa1P35175 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Stfa1P35175 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Stfa1P35175 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Stfa1P35175 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Stfa1P35175 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Stfa1P35175 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Stfa1P35175 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Stfa1P35175 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Stfa1P35175 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Stfa1P35175 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Stfa1P35175 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Stfa1P35175 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Stfa1P35175 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Stfa1P35175 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Stfa1P35175 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Stfa1P35175 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Stfa1P35175 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Stfa1P35175 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Stfa1P35175 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Stfa1P35175 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Stfa1P35175 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Stfa1P35175 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Stfa1P35175 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Stfa1P35175 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Stfa1P35175 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Stfa1P35175 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Stfa1P35175 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Stfa1P35175 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Stfa1P35175 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Stfa1P35175 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Stfa1P35175 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Stfa1P35175 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Stfa1P35175 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Stfa1P35175 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Stfa1P35175 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Stfa1P35175 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Stfa1P35175 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Stfa1P35175 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Stfa1P35175 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Stfa1P35175 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Stfa1P35175 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Stfa1P35175 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Stfa1P35175 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Stfa1P35175 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Stfa1P35175 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Stfa1P35175 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Stfa1P35175 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Stfa1P35175 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Stfa1P35175 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Stfa1P35175 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Stfa1P35175 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Stfa1P35175 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Stfa1P35175 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Stfa1P35175 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stfa1P35175 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stfa1P35175 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stfa1P35175 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stfa1P35175 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stfa1P35175 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stfa1P35175 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms