Protein–RNA interactions for Protein: P33435

Mmp13, Collagenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp13P33435 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mmp13P33435 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mmp13P33435 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mmp13P33435 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mmp13P33435 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mmp13P33435 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mmp13P33435 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mmp13P33435 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Mmp13P33435 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mmp13P33435 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mmp13P33435 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mmp13P33435 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mmp13P33435 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mmp13P33435 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mmp13P33435 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mmp13P33435 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mmp13P33435 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mmp13P33435 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mmp13P33435 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mmp13P33435 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mmp13P33435 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mmp13P33435 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Mmp13P33435 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Mmp13P33435 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mmp13P33435 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mmp13P33435 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mmp13P33435 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Mmp13P33435 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Mmp13P33435 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mmp13P33435 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mmp13P33435 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
Mmp13P33435 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mmp13P33435 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mmp13P33435 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mmp13P33435 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mmp13P33435 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mmp13P33435 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mmp13P33435 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mmp13P33435 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mmp13P33435 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Mmp13P33435 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mmp13P33435 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mmp13P33435 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mmp13P33435 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mmp13P33435 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mmp13P33435 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mmp13P33435 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mmp13P33435 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mmp13P33435 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mmp13P33435 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mmp13P33435 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mmp13P33435 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mmp13P33435 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mmp13P33435 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mmp13P33435 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mmp13P33435 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mmp13P33435 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mmp13P33435 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mmp13P33435 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mmp13P33435 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mmp13P33435 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mmp13P33435 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mmp13P33435 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mmp13P33435 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mmp13P33435 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mmp13P33435 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mmp13P33435 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mmp13P33435 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mmp13P33435 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Mmp13P33435 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mmp13P33435 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Mmp13P33435 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mmp13P33435 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mmp13P33435 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mmp13P33435 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mmp13P33435 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mmp13P33435 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mmp13P33435 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mmp13P33435 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mmp13P33435 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mmp13P33435 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mmp13P33435 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mmp13P33435 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mmp13P33435 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mmp13P33435 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mmp13P33435 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mmp13P33435 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Mmp13P33435 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mmp13P33435 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mmp13P33435 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Mmp13P33435 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mmp13P33435 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mmp13P33435 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mmp13P33435 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mmp13P33435 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Mmp13P33435 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Mmp13P33435 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mmp13P33435 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mmp13P33435 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mmp13P33435 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms