Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nedd1P33215 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nedd1P33215 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Nedd1P33215 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nedd1P33215 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Nedd1P33215 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nedd1P33215 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nedd1P33215 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nedd1P33215 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nedd1P33215 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nedd1P33215 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nedd1P33215 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nedd1P33215 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nedd1P33215 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nedd1P33215 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nedd1P33215 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nedd1P33215 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nedd1P33215 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nedd1P33215 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nedd1P33215 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nedd1P33215 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nedd1P33215 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nedd1P33215 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Nedd1P33215 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nedd1P33215 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nedd1P33215 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nedd1P33215 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nedd1P33215 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nedd1P33215 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nedd1P33215 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nedd1P33215 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nedd1P33215 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nedd1P33215 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nedd1P33215 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nedd1P33215 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nedd1P33215 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nedd1P33215 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nedd1P33215 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nedd1P33215 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nedd1P33215 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nedd1P33215 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Nedd1P33215 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nedd1P33215 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nedd1P33215 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nedd1P33215 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nedd1P33215 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Nedd1P33215 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nedd1P33215 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nedd1P33215 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nedd1P33215 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nedd1P33215 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nedd1P33215 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nedd1P33215 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nedd1P33215 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nedd1P33215 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nedd1P33215 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nedd1P33215 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nedd1P33215 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nedd1P33215 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Nedd1P33215 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nedd1P33215 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nedd1P33215 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nedd1P33215 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nedd1P33215 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nedd1P33215 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nedd1P33215 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nedd1P33215 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nedd1P33215 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nedd1P33215 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Nedd1P33215 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Nedd1P33215 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nedd1P33215 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nedd1P33215 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nedd1P33215 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nedd1P33215 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nedd1P33215 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nedd1P33215 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nedd1P33215 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nedd1P33215 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nedd1P33215 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nedd1P33215 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nedd1P33215 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nedd1P33215 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nedd1P33215 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Nedd1P33215 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nedd1P33215 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nedd1P33215 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nedd1P33215 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Nedd1P33215 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nedd1P33215 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nedd1P33215 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nedd1P33215 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nedd1P33215 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nedd1P33215 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nedd1P33215 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nedd1P33215 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nedd1P33215 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nedd1P33215 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nedd1P33215 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nedd1P33215 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms