Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Saa4P31532 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Saa4P31532 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Saa4P31532 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Saa4P31532 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Saa4P31532 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Saa4P31532 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Saa4P31532 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Saa4P31532 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Saa4P31532 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Saa4P31532 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Saa4P31532 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Saa4P31532 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Saa4P31532 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Saa4P31532 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Saa4P31532 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Saa4P31532 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Saa4P31532 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Saa4P31532 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Saa4P31532 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Saa4P31532 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Saa4P31532 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Saa4P31532 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Saa4P31532 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Saa4P31532 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Saa4P31532 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Saa4P31532 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Saa4P31532 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Saa4P31532 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Saa4P31532 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Saa4P31532 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Saa4P31532 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Saa4P31532 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Saa4P31532 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Saa4P31532 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Saa4P31532 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Saa4P31532 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Saa4P31532 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Saa4P31532 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Saa4P31532 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Saa4P31532 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Saa4P31532 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Saa4P31532 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Saa4P31532 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Saa4P31532 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Saa4P31532 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Saa4P31532 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Saa4P31532 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Saa4P31532 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Saa4P31532 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Saa4P31532 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Saa4P31532 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Saa4P31532 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Saa4P31532 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Saa4P31532 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Saa4P31532 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Saa4P31532 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Saa4P31532 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Saa4P31532 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Saa4P31532 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Saa4P31532 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Saa4P31532 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Saa4P31532 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Saa4P31532 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Saa4P31532 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Saa4P31532 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Saa4P31532 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Saa4P31532 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Saa4P31532 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Saa4P31532 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Saa4P31532 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Saa4P31532 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Saa4P31532 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Saa4P31532 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Saa4P31532 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Saa4P31532 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Saa4P31532 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Saa4P31532 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Saa4P31532 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Saa4P31532 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Saa4P31532 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Saa4P31532 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Saa4P31532 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Saa4P31532 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Saa4P31532 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Saa4P31532 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Saa4P31532 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Saa4P31532 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Saa4P31532 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Saa4P31532 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Saa4P31532 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Saa4P31532 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Saa4P31532 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Saa4P31532 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Saa4P31532 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Saa4P31532 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Saa4P31532 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Saa4P31532 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Saa4P31532 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Saa4P31532 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms