Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hoxc10P31257 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hoxc10P31257 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hoxc10P31257 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hoxc10P31257 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hoxc10P31257 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hoxc10P31257 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hoxc10P31257 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hoxc10P31257 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hoxc10P31257 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hoxc10P31257 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hoxc10P31257 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hoxc10P31257 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hoxc10P31257 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hoxc10P31257 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hoxc10P31257 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hoxc10P31257 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Hoxc10P31257 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hoxc10P31257 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hoxc10P31257 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Hoxc10P31257 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Hoxc10P31257 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hoxc10P31257 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hoxc10P31257 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hoxc10P31257 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hoxc10P31257 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Hoxc10P31257 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Hoxc10P31257 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Hoxc10P31257 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Hoxc10P31257 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hoxc10P31257 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hoxc10P31257 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hoxc10P31257 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hoxc10P31257 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hoxc10P31257 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hoxc10P31257 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hoxc10P31257 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hoxc10P31257 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hoxc10P31257 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Hoxc10P31257 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hoxc10P31257 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hoxc10P31257 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hoxc10P31257 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hoxc10P31257 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hoxc10P31257 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hoxc10P31257 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hoxc10P31257 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hoxc10P31257 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hoxc10P31257 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hoxc10P31257 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Hoxc10P31257 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hoxc10P31257 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Hoxc10P31257 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hoxc10P31257 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hoxc10P31257 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hoxc10P31257 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hoxc10P31257 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hoxc10P31257 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Hoxc10P31257 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hoxc10P31257 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hoxc10P31257 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hoxc10P31257 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hoxc10P31257 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Hoxc10P31257 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Hoxc10P31257 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Hoxc10P31257 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hoxc10P31257 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Hoxc10P31257 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hoxc10P31257 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hoxc10P31257 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hoxc10P31257 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hoxc10P31257 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hoxc10P31257 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hoxc10P31257 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hoxc10P31257 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hoxc10P31257 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hoxc10P31257 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hoxc10P31257 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hoxc10P31257 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hoxc10P31257 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hoxc10P31257 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hoxc10P31257 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hoxc10P31257 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hoxc10P31257 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hoxc10P31257 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hoxc10P31257 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hoxc10P31257 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hoxc10P31257 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hoxc10P31257 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hoxc10P31257 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hoxc10P31257 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hoxc10P31257 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hoxc10P31257 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hoxc10P31257 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hoxc10P31257 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hoxc10P31257 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hoxc10P31257 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hoxc10P31257 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hoxc10P31257 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hoxc10P31257 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms