Protein–RNA interactions for Protein: P30282

Ccnd3, G1/S-specific cyclin-D3, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd3P30282 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccnd3P30282 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccnd3P30282 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccnd3P30282 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccnd3P30282 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccnd3P30282 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccnd3P30282 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccnd3P30282 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccnd3P30282 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccnd3P30282 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccnd3P30282 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccnd3P30282 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccnd3P30282 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccnd3P30282 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccnd3P30282 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccnd3P30282 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccnd3P30282 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccnd3P30282 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccnd3P30282 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccnd3P30282 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccnd3P30282 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccnd3P30282 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccnd3P30282 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccnd3P30282 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccnd3P30282 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccnd3P30282 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccnd3P30282 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccnd3P30282 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccnd3P30282 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccnd3P30282 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccnd3P30282 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccnd3P30282 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccnd3P30282 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccnd3P30282 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccnd3P30282 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccnd3P30282 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccnd3P30282 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccnd3P30282 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccnd3P30282 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccnd3P30282 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccnd3P30282 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccnd3P30282 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccnd3P30282 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccnd3P30282 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccnd3P30282 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccnd3P30282 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccnd3P30282 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccnd3P30282 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccnd3P30282 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccnd3P30282 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccnd3P30282 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccnd3P30282 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccnd3P30282 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccnd3P30282 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccnd3P30282 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccnd3P30282 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccnd3P30282 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccnd3P30282 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccnd3P30282 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccnd3P30282 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccnd3P30282 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccnd3P30282 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccnd3P30282 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccnd3P30282 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccnd3P30282 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccnd3P30282 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccnd3P30282 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccnd3P30282 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccnd3P30282 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccnd3P30282 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccnd3P30282 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccnd3P30282 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccnd3P30282 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccnd3P30282 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccnd3P30282 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccnd3P30282 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccnd3P30282 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccnd3P30282 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccnd3P30282 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccnd3P30282 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccnd3P30282 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccnd3P30282 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccnd3P30282 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccnd3P30282 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccnd3P30282 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccnd3P30282 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccnd3P30282 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccnd3P30282 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccnd3P30282 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccnd3P30282 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccnd3P30282 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccnd3P30282 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccnd3P30282 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccnd3P30282 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccnd3P30282 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccnd3P30282 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccnd3P30282 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccnd3P30282 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccnd3P30282 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccnd3P30282 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms