Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pabpc1P29341 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pabpc1P29341 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pabpc1P29341 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pabpc1P29341 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pabpc1P29341 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Pabpc1P29341 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pabpc1P29341 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pabpc1P29341 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pabpc1P29341 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pabpc1P29341 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pabpc1P29341 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pabpc1P29341 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pabpc1P29341 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pabpc1P29341 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pabpc1P29341 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pabpc1P29341 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pabpc1P29341 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pabpc1P29341 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pabpc1P29341 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pabpc1P29341 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pabpc1P29341 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pabpc1P29341 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pabpc1P29341 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pabpc1P29341 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Pabpc1P29341 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pabpc1P29341 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pabpc1P29341 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Pabpc1P29341 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pabpc1P29341 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pabpc1P29341 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pabpc1P29341 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pabpc1P29341 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pabpc1P29341 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pabpc1P29341 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pabpc1P29341 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Pabpc1P29341 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pabpc1P29341 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pabpc1P29341 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pabpc1P29341 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pabpc1P29341 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pabpc1P29341 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pabpc1P29341 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pabpc1P29341 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pabpc1P29341 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pabpc1P29341 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pabpc1P29341 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pabpc1P29341 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pabpc1P29341 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pabpc1P29341 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pabpc1P29341 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pabpc1P29341 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pabpc1P29341 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Pabpc1P29341 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pabpc1P29341 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pabpc1P29341 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pabpc1P29341 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pabpc1P29341 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pabpc1P29341 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pabpc1P29341 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Pabpc1P29341 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pabpc1P29341 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pabpc1P29341 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pabpc1P29341 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pabpc1P29341 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pabpc1P29341 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pabpc1P29341 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pabpc1P29341 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pabpc1P29341 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pabpc1P29341 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pabpc1P29341 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pabpc1P29341 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pabpc1P29341 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pabpc1P29341 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pabpc1P29341 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pabpc1P29341 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pabpc1P29341 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Pabpc1P29341 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pabpc1P29341 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pabpc1P29341 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pabpc1P29341 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pabpc1P29341 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pabpc1P29341 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pabpc1P29341 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pabpc1P29341 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pabpc1P29341 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pabpc1P29341 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pabpc1P29341 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Pabpc1P29341 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pabpc1P29341 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pabpc1P29341 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Pabpc1P29341 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pabpc1P29341 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pabpc1P29341 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pabpc1P29341 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Pabpc1P29341 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pabpc1P29341 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pabpc1P29341 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pabpc1P29341 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pabpc1P29341 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.5 ms