Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PrkcdP28867 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PrkcdP28867 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PrkcdP28867 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PrkcdP28867 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PrkcdP28867 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PrkcdP28867 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PrkcdP28867 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PrkcdP28867 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PrkcdP28867 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PrkcdP28867 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PrkcdP28867 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PrkcdP28867 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PrkcdP28867 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PrkcdP28867 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PrkcdP28867 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PrkcdP28867 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PrkcdP28867 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PrkcdP28867 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PrkcdP28867 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PrkcdP28867 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PrkcdP28867 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PrkcdP28867 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PrkcdP28867 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PrkcdP28867 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PrkcdP28867 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PrkcdP28867 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PrkcdP28867 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PrkcdP28867 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PrkcdP28867 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PrkcdP28867 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PrkcdP28867 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PrkcdP28867 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PrkcdP28867 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PrkcdP28867 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PrkcdP28867 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PrkcdP28867 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PrkcdP28867 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PrkcdP28867 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PrkcdP28867 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PrkcdP28867 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PrkcdP28867 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PrkcdP28867 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PrkcdP28867 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PrkcdP28867 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PrkcdP28867 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PrkcdP28867 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PrkcdP28867 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PrkcdP28867 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PrkcdP28867 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PrkcdP28867 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PrkcdP28867 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PrkcdP28867 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PrkcdP28867 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PrkcdP28867 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PrkcdP28867 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PrkcdP28867 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PrkcdP28867 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PrkcdP28867 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PrkcdP28867 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PrkcdP28867 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PrkcdP28867 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PrkcdP28867 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrkcdP28867 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrkcdP28867 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrkcdP28867 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrkcdP28867 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PrkcdP28867 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PrkcdP28867 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PrkcdP28867 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PrkcdP28867 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PrkcdP28867 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PrkcdP28867 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PrkcdP28867 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PrkcdP28867 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PrkcdP28867 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PrkcdP28867 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PrkcdP28867 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PrkcdP28867 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PrkcdP28867 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PrkcdP28867 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PrkcdP28867 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PrkcdP28867 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PrkcdP28867 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PrkcdP28867 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PrkcdP28867 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PrkcdP28867 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PrkcdP28867 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PrkcdP28867 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PrkcdP28867 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PrkcdP28867 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PrkcdP28867 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PrkcdP28867 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PrkcdP28867 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PrkcdP28867 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PrkcdP28867 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PrkcdP28867 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PrkcdP28867 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PrkcdP28867 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PrkcdP28867 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms