Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RxrgP28705 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RxrgP28705 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RxrgP28705 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RxrgP28705 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RxrgP28705 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RxrgP28705 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RxrgP28705 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RxrgP28705 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RxrgP28705 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RxrgP28705 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RxrgP28705 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RxrgP28705 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RxrgP28705 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RxrgP28705 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RxrgP28705 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RxrgP28705 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RxrgP28705 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RxrgP28705 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RxrgP28705 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RxrgP28705 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RxrgP28705 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RxrgP28705 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RxrgP28705 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RxrgP28705 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RxrgP28705 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RxrgP28705 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RxrgP28705 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RxrgP28705 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RxrgP28705 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
RxrgP28705 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RxrgP28705 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RxrgP28705 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RxrgP28705 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RxrgP28705 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RxrgP28705 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RxrgP28705 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RxrgP28705 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RxrgP28705 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RxrgP28705 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RxrgP28705 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RxrgP28705 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RxrgP28705 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RxrgP28705 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RxrgP28705 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RxrgP28705 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RxrgP28705 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RxrgP28705 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RxrgP28705 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RxrgP28705 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RxrgP28705 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RxrgP28705 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RxrgP28705 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RxrgP28705 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RxrgP28705 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RxrgP28705 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RxrgP28705 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RxrgP28705 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RxrgP28705 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RxrgP28705 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RxrgP28705 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RxrgP28705 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RxrgP28705 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RxrgP28705 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RxrgP28705 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RxrgP28705 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RxrgP28705 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RxrgP28705 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RxrgP28705 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RxrgP28705 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RxrgP28705 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RxrgP28705 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RxrgP28705 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RxrgP28705 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RxrgP28705 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RxrgP28705 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RxrgP28705 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RxrgP28705 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RxrgP28705 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RxrgP28705 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RxrgP28705 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RxrgP28705 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RxrgP28705 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RxrgP28705 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RxrgP28705 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RxrgP28705 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RxrgP28705 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RxrgP28705 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RxrgP28705 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RxrgP28705 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RxrgP28705 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RxrgP28705 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RxrgP28705 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RxrgP28705 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RxrgP28705 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RxrgP28705 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RxrgP28705 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RxrgP28705 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RxrgP28705 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RxrgP28705 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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