Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxd9P28357 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxd9P28357 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxd9P28357 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxd9P28357 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxd9P28357 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxd9P28357 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxd9P28357 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxd9P28357 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxd9P28357 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxd9P28357 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxd9P28357 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxd9P28357 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxd9P28357 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxd9P28357 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxd9P28357 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxd9P28357 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxd9P28357 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxd9P28357 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxd9P28357 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxd9P28357 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxd9P28357 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxd9P28357 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxd9P28357 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxd9P28357 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxd9P28357 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hoxd9P28357 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hoxd9P28357 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hoxd9P28357 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hoxd9P28357 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hoxd9P28357 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hoxd9P28357 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hoxd9P28357 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxd9P28357 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxd9P28357 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxd9P28357 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxd9P28357 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxd9P28357 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxd9P28357 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxd9P28357 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Hoxd9P28357 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Hoxd9P28357 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxd9P28357 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxd9P28357 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxd9P28357 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxd9P28357 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxd9P28357 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxd9P28357 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxd9P28357 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxd9P28357 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxd9P28357 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxd9P28357 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxd9P28357 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxd9P28357 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxd9P28357 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxd9P28357 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxd9P28357 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxd9P28357 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hoxd9P28357 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hoxd9P28357 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hoxd9P28357 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hoxd9P28357 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hoxd9P28357 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hoxd9P28357 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hoxd9P28357 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hoxd9P28357 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hoxd9P28357 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hoxd9P28357 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxd9P28357 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxd9P28357 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxd9P28357 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxd9P28357 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxd9P28357 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxd9P28357 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxd9P28357 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxd9P28357 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxd9P28357 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxd9P28357 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxd9P28357 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxd9P28357 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxd9P28357 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxd9P28357 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxd9P28357 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxd9P28357 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxd9P28357 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxd9P28357 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxd9P28357 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxd9P28357 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxd9P28357 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxd9P28357 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxd9P28357 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxd9P28357 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxd9P28357 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxd9P28357 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxd9P28357 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxd9P28357 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxd9P28357 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxd9P28357 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxd9P28357 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxd9P28357 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms