Protein–RNA interactions for Protein: P28301

Lox, Protein-lysine 6-oxidase, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LoxP28301 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LoxP28301 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
LoxP28301 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
LoxP28301 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LoxP28301 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LoxP28301 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LoxP28301 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LoxP28301 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LoxP28301 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LoxP28301 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LoxP28301 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LoxP28301 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LoxP28301 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LoxP28301 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
LoxP28301 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
LoxP28301 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LoxP28301 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LoxP28301 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
LoxP28301 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LoxP28301 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LoxP28301 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LoxP28301 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LoxP28301 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LoxP28301 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LoxP28301 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LoxP28301 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LoxP28301 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LoxP28301 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
LoxP28301 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LoxP28301 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LoxP28301 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LoxP28301 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LoxP28301 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LoxP28301 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LoxP28301 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LoxP28301 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LoxP28301 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LoxP28301 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LoxP28301 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LoxP28301 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LoxP28301 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
LoxP28301 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LoxP28301 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LoxP28301 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LoxP28301 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LoxP28301 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LoxP28301 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LoxP28301 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LoxP28301 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LoxP28301 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LoxP28301 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LoxP28301 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LoxP28301 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LoxP28301 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LoxP28301 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LoxP28301 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LoxP28301 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LoxP28301 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LoxP28301 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
LoxP28301 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LoxP28301 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LoxP28301 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LoxP28301 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LoxP28301 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LoxP28301 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LoxP28301 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LoxP28301 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LoxP28301 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LoxP28301 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LoxP28301 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LoxP28301 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
LoxP28301 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LoxP28301 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LoxP28301 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LoxP28301 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LoxP28301 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LoxP28301 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LoxP28301 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LoxP28301 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LoxP28301 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LoxP28301 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
LoxP28301 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LoxP28301 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LoxP28301 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LoxP28301 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
LoxP28301 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LoxP28301 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LoxP28301 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LoxP28301 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LoxP28301 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LoxP28301 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LoxP28301 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LoxP28301 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LoxP28301 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LoxP28301 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LoxP28301 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LoxP28301 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LoxP28301 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LoxP28301 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LoxP28301 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms