Protein–RNA interactions for Protein: P28271

Aco1, Cytoplasmic aconitate hydratase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aco1P28271 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Aco1P28271 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Aco1P28271 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Aco1P28271 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Aco1P28271 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Aco1P28271 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Aco1P28271 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Aco1P28271 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Aco1P28271 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Aco1P28271 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Aco1P28271 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Aco1P28271 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Aco1P28271 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Aco1P28271 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Aco1P28271 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Aco1P28271 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Aco1P28271 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Aco1P28271 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Aco1P28271 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Aco1P28271 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Aco1P28271 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Aco1P28271 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Aco1P28271 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Aco1P28271 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Aco1P28271 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Aco1P28271 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Aco1P28271 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Aco1P28271 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Aco1P28271 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Aco1P28271 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Aco1P28271 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Aco1P28271 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Aco1P28271 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Aco1P28271 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Aco1P28271 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Aco1P28271 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Aco1P28271 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Aco1P28271 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Aco1P28271 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Aco1P28271 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Aco1P28271 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Aco1P28271 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Aco1P28271 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Aco1P28271 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Aco1P28271 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Aco1P28271 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Aco1P28271 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Aco1P28271 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Aco1P28271 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Aco1P28271 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Aco1P28271 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Aco1P28271 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Aco1P28271 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Aco1P28271 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Aco1P28271 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Aco1P28271 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Aco1P28271 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Aco1P28271 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Aco1P28271 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Aco1P28271 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Aco1P28271 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Aco1P28271 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Aco1P28271 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Aco1P28271 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Aco1P28271 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Aco1P28271 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Aco1P28271 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Aco1P28271 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Aco1P28271 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Aco1P28271 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Aco1P28271 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Aco1P28271 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Aco1P28271 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Aco1P28271 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Aco1P28271 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Aco1P28271 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Aco1P28271 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Aco1P28271 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Aco1P28271 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Aco1P28271 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Aco1P28271 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Aco1P28271 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Aco1P28271 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Aco1P28271 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Aco1P28271 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Aco1P28271 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Aco1P28271 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Aco1P28271 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Aco1P28271 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Aco1P28271 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Aco1P28271 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Aco1P28271 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Aco1P28271 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Aco1P28271 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Aco1P28271 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Aco1P28271 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Aco1P28271 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Aco1P28271 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Aco1P28271 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Aco1P28271 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms