Protein–RNA interactions for Protein: P28236

Gja8, Gap junction alpha-8 protein, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja8P28236 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gja8P28236 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Gja8P28236 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gja8P28236 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gja8P28236 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gja8P28236 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gja8P28236 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gja8P28236 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gja8P28236 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gja8P28236 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gja8P28236 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gja8P28236 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gja8P28236 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gja8P28236 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gja8P28236 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gja8P28236 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gja8P28236 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gja8P28236 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gja8P28236 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gja8P28236 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gja8P28236 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gja8P28236 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gja8P28236 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gja8P28236 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gja8P28236 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gja8P28236 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Gja8P28236 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gja8P28236 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gja8P28236 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gja8P28236 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gja8P28236 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gja8P28236 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gja8P28236 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Gja8P28236 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gja8P28236 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gja8P28236 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gja8P28236 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gja8P28236 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gja8P28236 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gja8P28236 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gja8P28236 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gja8P28236 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gja8P28236 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gja8P28236 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gja8P28236 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gja8P28236 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gja8P28236 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gja8P28236 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gja8P28236 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Gja8P28236 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gja8P28236 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gja8P28236 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gja8P28236 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gja8P28236 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gja8P28236 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gja8P28236 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gja8P28236 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gja8P28236 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gja8P28236 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gja8P28236 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gja8P28236 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gja8P28236 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gja8P28236 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gja8P28236 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gja8P28236 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Gja8P28236 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gja8P28236 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gja8P28236 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gja8P28236 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gja8P28236 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gja8P28236 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gja8P28236 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gja8P28236 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gja8P28236 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gja8P28236 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gja8P28236 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Gja8P28236 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gja8P28236 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gja8P28236 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gja8P28236 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gja8P28236 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gja8P28236 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gja8P28236 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gja8P28236 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gja8P28236 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gja8P28236 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gja8P28236 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gja8P28236 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gja8P28236 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gja8P28236 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gja8P28236 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gja8P28236 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gja8P28236 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gja8P28236 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gja8P28236 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gja8P28236 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gja8P28236 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gja8P28236 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gja8P28236 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gja8P28236 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms