Protein–RNA interactions for Protein: P28229

Gjc1, Gap junction gamma-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjc1P28229 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gjc1P28229 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gjc1P28229 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gjc1P28229 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gjc1P28229 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gjc1P28229 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gjc1P28229 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gjc1P28229 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gjc1P28229 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gjc1P28229 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gjc1P28229 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gjc1P28229 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gjc1P28229 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gjc1P28229 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gjc1P28229 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gjc1P28229 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gjc1P28229 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gjc1P28229 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gjc1P28229 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gjc1P28229 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gjc1P28229 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gjc1P28229 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gjc1P28229 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gjc1P28229 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gjc1P28229 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gjc1P28229 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gjc1P28229 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gjc1P28229 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gjc1P28229 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gjc1P28229 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gjc1P28229 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gjc1P28229 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Gjc1P28229 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gjc1P28229 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gjc1P28229 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gjc1P28229 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gjc1P28229 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gjc1P28229 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gjc1P28229 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gjc1P28229 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gjc1P28229 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gjc1P28229 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gjc1P28229 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gjc1P28229 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gjc1P28229 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Gjc1P28229 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gjc1P28229 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gjc1P28229 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gjc1P28229 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gjc1P28229 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gjc1P28229 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gjc1P28229 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gjc1P28229 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gjc1P28229 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gjc1P28229 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gjc1P28229 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gjc1P28229 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gjc1P28229 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gjc1P28229 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gjc1P28229 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gjc1P28229 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gjc1P28229 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Gjc1P28229 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Gjc1P28229 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gjc1P28229 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gjc1P28229 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Gjc1P28229 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gjc1P28229 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Gjc1P28229 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gjc1P28229 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gjc1P28229 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gjc1P28229 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gjc1P28229 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gjc1P28229 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gjc1P28229 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gjc1P28229 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gjc1P28229 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gjc1P28229 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gjc1P28229 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gjc1P28229 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gjc1P28229 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gjc1P28229 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gjc1P28229 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gjc1P28229 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gjc1P28229 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gjc1P28229 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Gjc1P28229 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gjc1P28229 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Gjc1P28229 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gjc1P28229 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gjc1P28229 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gjc1P28229 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Gjc1P28229 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gjc1P28229 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gjc1P28229 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gjc1P28229 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gjc1P28229 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gjc1P28229 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gjc1P28229 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gjc1P28229 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms