Protein–RNA interactions for Protein: P28063

Psmb8, Proteasome subunit beta type-8, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb8P28063 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmb8P28063 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmb8P28063 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmb8P28063 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmb8P28063 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmb8P28063 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmb8P28063 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psmb8P28063 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psmb8P28063 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psmb8P28063 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psmb8P28063 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psmb8P28063 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Psmb8P28063 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psmb8P28063 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psmb8P28063 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psmb8P28063 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psmb8P28063 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psmb8P28063 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psmb8P28063 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psmb8P28063 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psmb8P28063 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psmb8P28063 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psmb8P28063 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psmb8P28063 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Psmb8P28063 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psmb8P28063 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psmb8P28063 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmb8P28063 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmb8P28063 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmb8P28063 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmb8P28063 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmb8P28063 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmb8P28063 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmb8P28063 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmb8P28063 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmb8P28063 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmb8P28063 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmb8P28063 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmb8P28063 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmb8P28063 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmb8P28063 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmb8P28063 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmb8P28063 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmb8P28063 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmb8P28063 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmb8P28063 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmb8P28063 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmb8P28063 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmb8P28063 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmb8P28063 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmb8P28063 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmb8P28063 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmb8P28063 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmb8P28063 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmb8P28063 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmb8P28063 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmb8P28063 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmb8P28063 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmb8P28063 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmb8P28063 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmb8P28063 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmb8P28063 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmb8P28063 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmb8P28063 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmb8P28063 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmb8P28063 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmb8P28063 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmb8P28063 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmb8P28063 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmb8P28063 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmb8P28063 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmb8P28063 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmb8P28063 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmb8P28063 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmb8P28063 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmb8P28063 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmb8P28063 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmb8P28063 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmb8P28063 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmb8P28063 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmb8P28063 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmb8P28063 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmb8P28063 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmb8P28063 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmb8P28063 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmb8P28063 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmb8P28063 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmb8P28063 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmb8P28063 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmb8P28063 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmb8P28063 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmb8P28063 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmb8P28063 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmb8P28063 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmb8P28063 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmb8P28063 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmb8P28063 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmb8P28063 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmb8P28063 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmb8P28063 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms