Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pde6aP27664 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pde6aP27664 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pde6aP27664 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pde6aP27664 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pde6aP27664 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pde6aP27664 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pde6aP27664 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pde6aP27664 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pde6aP27664 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pde6aP27664 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pde6aP27664 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pde6aP27664 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pde6aP27664 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pde6aP27664 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pde6aP27664 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pde6aP27664 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Pde6aP27664 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pde6aP27664 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pde6aP27664 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pde6aP27664 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pde6aP27664 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pde6aP27664 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pde6aP27664 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pde6aP27664 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pde6aP27664 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Pde6aP27664 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Pde6aP27664 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pde6aP27664 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pde6aP27664 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pde6aP27664 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pde6aP27664 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pde6aP27664 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pde6aP27664 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pde6aP27664 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pde6aP27664 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pde6aP27664 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Pde6aP27664 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pde6aP27664 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pde6aP27664 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pde6aP27664 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pde6aP27664 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pde6aP27664 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pde6aP27664 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pde6aP27664 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pde6aP27664 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pde6aP27664 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Pde6aP27664 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pde6aP27664 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pde6aP27664 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Pde6aP27664 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pde6aP27664 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pde6aP27664 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pde6aP27664 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pde6aP27664 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pde6aP27664 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pde6aP27664 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pde6aP27664 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Pde6aP27664 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pde6aP27664 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pde6aP27664 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pde6aP27664 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pde6aP27664 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pde6aP27664 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pde6aP27664 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pde6aP27664 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pde6aP27664 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pde6aP27664 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pde6aP27664 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pde6aP27664 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pde6aP27664 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Pde6aP27664 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Pde6aP27664 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pde6aP27664 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pde6aP27664 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pde6aP27664 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Pde6aP27664 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pde6aP27664 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pde6aP27664 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Pde6aP27664 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pde6aP27664 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pde6aP27664 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pde6aP27664 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pde6aP27664 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pde6aP27664 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pde6aP27664 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pde6aP27664 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pde6aP27664 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pde6aP27664 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pde6aP27664 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pde6aP27664 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pde6aP27664 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pde6aP27664 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pde6aP27664 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pde6aP27664 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pde6aP27664 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pde6aP27664 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pde6aP27664 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pde6aP27664 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pde6aP27664 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
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