Protein–RNA interactions for Protein: P25799

Nfkb1, Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfkb1P25799 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nfkb1P25799 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nfkb1P25799 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nfkb1P25799 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nfkb1P25799 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nfkb1P25799 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nfkb1P25799 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nfkb1P25799 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nfkb1P25799 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nfkb1P25799 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nfkb1P25799 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Nfkb1P25799 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nfkb1P25799 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nfkb1P25799 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nfkb1P25799 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nfkb1P25799 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nfkb1P25799 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nfkb1P25799 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nfkb1P25799 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nfkb1P25799 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Nfkb1P25799 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Nfkb1P25799 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nfkb1P25799 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nfkb1P25799 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nfkb1P25799 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nfkb1P25799 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Nfkb1P25799 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nfkb1P25799 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nfkb1P25799 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nfkb1P25799 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nfkb1P25799 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nfkb1P25799 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nfkb1P25799 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nfkb1P25799 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nfkb1P25799 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nfkb1P25799 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nfkb1P25799 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nfkb1P25799 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Nfkb1P25799 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nfkb1P25799 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nfkb1P25799 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nfkb1P25799 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nfkb1P25799 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nfkb1P25799 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Nfkb1P25799 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nfkb1P25799 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nfkb1P25799 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nfkb1P25799 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nfkb1P25799 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nfkb1P25799 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nfkb1P25799 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nfkb1P25799 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nfkb1P25799 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nfkb1P25799 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nfkb1P25799 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nfkb1P25799 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nfkb1P25799 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nfkb1P25799 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nfkb1P25799 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nfkb1P25799 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nfkb1P25799 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nfkb1P25799 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nfkb1P25799 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nfkb1P25799 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Nfkb1P25799 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nfkb1P25799 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nfkb1P25799 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nfkb1P25799 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nfkb1P25799 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nfkb1P25799 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nfkb1P25799 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nfkb1P25799 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nfkb1P25799 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nfkb1P25799 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nfkb1P25799 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nfkb1P25799 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nfkb1P25799 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nfkb1P25799 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nfkb1P25799 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nfkb1P25799 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nfkb1P25799 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nfkb1P25799 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Nfkb1P25799 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nfkb1P25799 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nfkb1P25799 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nfkb1P25799 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nfkb1P25799 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nfkb1P25799 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nfkb1P25799 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nfkb1P25799 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nfkb1P25799 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nfkb1P25799 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nfkb1P25799 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nfkb1P25799 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nfkb1P25799 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nfkb1P25799 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nfkb1P25799 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nfkb1P25799 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nfkb1P25799 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nfkb1P25799 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.8 ms