Protein–RNA interactions for Protein: P24161

Cd247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, mousemouse

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd247P24161 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cd247P24161 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cd247P24161 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cd247P24161 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cd247P24161 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cd247P24161 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cd247P24161 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cd247P24161 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cd247P24161 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cd247P24161 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cd247P24161 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cd247P24161 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cd247P24161 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cd247P24161 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cd247P24161 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cd247P24161 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cd247P24161 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cd247P24161 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cd247P24161 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cd247P24161 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cd247P24161 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cd247P24161 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cd247P24161 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cd247P24161 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Cd247P24161 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cd247P24161 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Cd247P24161 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cd247P24161 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cd247P24161 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cd247P24161 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cd247P24161 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cd247P24161 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cd247P24161 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cd247P24161 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cd247P24161 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cd247P24161 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cd247P24161 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cd247P24161 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cd247P24161 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cd247P24161 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cd247P24161 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cd247P24161 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cd247P24161 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cd247P24161 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cd247P24161 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cd247P24161 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cd247P24161 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cd247P24161 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cd247P24161 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cd247P24161 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cd247P24161 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cd247P24161 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cd247P24161 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cd247P24161 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Cd247P24161 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cd247P24161 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Cd247P24161 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cd247P24161 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cd247P24161 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cd247P24161 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Cd247P24161 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cd247P24161 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cd247P24161 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cd247P24161 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cd247P24161 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cd247P24161 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Cd247P24161 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Cd247P24161 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cd247P24161 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cd247P24161 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cd247P24161 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cd247P24161 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cd247P24161 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cd247P24161 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cd247P24161 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cd247P24161 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cd247P24161 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cd247P24161 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cd247P24161 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cd247P24161 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cd247P24161 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cd247P24161 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cd247P24161 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cd247P24161 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd247P24161 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd247P24161 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd247P24161 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cd247P24161 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Cd247P24161 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cd247P24161 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cd247P24161 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cd247P24161 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Cd247P24161 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cd247P24161 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cd247P24161 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cd247P24161 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cd247P24161 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cd247P24161 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cd247P24161 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cd247P24161 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms