Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ggta1P23336 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ggta1P23336 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ggta1P23336 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ggta1P23336 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ggta1P23336 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ggta1P23336 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ggta1P23336 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ggta1P23336 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ggta1P23336 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ggta1P23336 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ggta1P23336 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ggta1P23336 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ggta1P23336 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ggta1P23336 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ggta1P23336 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ggta1P23336 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ggta1P23336 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ggta1P23336 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ggta1P23336 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ggta1P23336 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ggta1P23336 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ggta1P23336 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ggta1P23336 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ggta1P23336 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ggta1P23336 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ggta1P23336 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ggta1P23336 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ggta1P23336 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ggta1P23336 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ggta1P23336 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ggta1P23336 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ggta1P23336 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ggta1P23336 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ggta1P23336 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ggta1P23336 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ggta1P23336 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ggta1P23336 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ggta1P23336 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ggta1P23336 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ggta1P23336 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ggta1P23336 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ggta1P23336 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ggta1P23336 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ggta1P23336 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ggta1P23336 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ggta1P23336 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ggta1P23336 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ggta1P23336 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ggta1P23336 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ggta1P23336 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ggta1P23336 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ggta1P23336 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ggta1P23336 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ggta1P23336 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ggta1P23336 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ggta1P23336 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ggta1P23336 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ggta1P23336 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ggta1P23336 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ggta1P23336 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ggta1P23336 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ggta1P23336 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ggta1P23336 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ggta1P23336 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ggta1P23336 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ggta1P23336 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ggta1P23336 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ggta1P23336 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ggta1P23336 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ggta1P23336 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ggta1P23336 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ggta1P23336 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ggta1P23336 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ggta1P23336 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ggta1P23336 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ggta1P23336 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ggta1P23336 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ggta1P23336 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ggta1P23336 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ggta1P23336 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ggta1P23336 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ggta1P23336 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ggta1P23336 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ggta1P23336 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ggta1P23336 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ggta1P23336 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ggta1P23336 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ggta1P23336 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ggta1P23336 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ggta1P23336 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ggta1P23336 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ggta1P23336 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ggta1P23336 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ggta1P23336 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ggta1P23336 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ggta1P23336 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ggta1P23336 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ggta1P23336 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ggta1P23336 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms